提问人:eazyezy 提问时间:11/16/2023 更新时间:11/18/2023 访问量:27
ELSA 包(空间关联):我的分类栅格数据未按预期运行。
ELSA package (spatial association): My categorical raster data do not behave as intended
问:
我已经开始使用软件包 (https://cran.r-project.org/web/packages/elsa/vignettes/elsa.html) 来测量分类数据的基于熵的空间关联,但它主要围绕栅格数据展开,我以前对此几乎没有经验。
我的数据来自一个.tif文件,我在QGIS中将其像素值重新分类为5个类别。elsa
library(raster)
r <- new("RasterLayer", file = new(".RasterFile", name = "C:\\Users\\bluew\\Desktop\\stefano\\ELSA\\are_1.81_3003.tif",
datanotation = "FLT4S", byteorder = "little", nodatavalue = -Inf,
NAchanged = FALSE, nbands = 1L, bandorder = "BIL", offset = 0L,
toptobottom = TRUE, blockrows = c(rows = 1L), blockcols = c(cols = 1062L),
driver = "gdal", open = FALSE), data = new(".SingleLayerData",
values = logical(0), offset = 0, gain = 1, inmemory = FALSE,
fromdisk = TRUE, isfactor = FALSE, attributes = list(), haveminmax = TRUE,
min = 1, max = 5, band = 1L, unit = "", names = "are_1.81_3003"),
legend = new(".RasterLegend", type = character(0), values = logical(0),
color = logical(0), names = logical(0), colortable = logical(0)),
title = character(0), extent = new("Extent", xmin = 1478031.1565,
xmax = 1563459.1172, ymin = 4933676.6029, ymax = 5009134.9516),
rotated = FALSE, rotation = new(".Rotation", geotrans = numeric(0),
transfun = function ()
NULL), ncols = 1062L, nrows = 662L, crs = new("CRS",
projargs = "+proj=tmerc +lat_0=0 +lon_0=9 +k=0.9996 +x_0=1500000 +y_0=0 +ellps=intl +units=m +no_defs"),
srs = "+proj=tmerc +lat_0=0 +lon_0=9 +k=0.9996 +x_0=1500000 +y_0=0 +ellps=intl +units=m +no_defs",
history = list(), z = list())
r <- setMinMax(r,force=T)
我将其提交给函数:elsa
library(elsa)
e <- elsa(r,d=500,categorical = T) #the d argument defines the neighbourhood of each pixel
这应该会产生一个包含每个像素的 ELSA 值的对象,但我的结果有点奇怪:RasterLayer
library(tmap)
cl <- colorRampPalette(c('darkblue','yellow','red','black'))(100)
tm_shape(e) + tm_raster(palette= cl, title = "ELSA",style="cont") +
tm_layout(legend.outside = T)
正如您在下面看到的,看起来好像只在每个类别的边缘计算值,这没有意义。
我上面链接的小插图中提供的示例看起来完全不是这样,但是没有关于如何准备栅格数据的进一步文档,而且正如我所说,我对如何处理它们的经验很少。
这很可能与我在QGIS中对栅格进行重新分类的方式有关,但我真的说不出来;我尝试将我的栅格与包中提供的栅格进行比较,但无法发现显着差异。
谁能给我指出可能导致这种结果的方向?
感谢任何提供建议的人。
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