无效的类“LogMap”对象：尝试创建 Seurat 对象时必须提供行名

问：

我一直在尝试创建一个修拉对象：

nuc.seurat <- CreateSeuratObject(counts = as.matrix(UMIs), project = i, min.cells = 3, min.features = 200)

但是，我不断收到以下错误：

Error in validObject(.Object) : 
  invalid class “LogMap” object: Rownames must be supplied

奇怪的是，就在一天前，它在完全相同的管道下工作完全正常。 在本例中，UMI 是一个计数数据帧，它具有行名（尽管错误提示了什么）：

         Sample1 Sample2 Sample3 Sample4
A1BG          21       0       6       1
A1BG-AS1       2       0       0       0
A1CF           9       3       8       2
A2M           17       0       4       0
A2M-AS1        0       0       0       0

（UMI 要大得多，这只是一个子集）

我在 R 或使用 Seurat 方面没有太多经验，所以任何输入都会有所帮助！谢谢！

我尝试删除一些 pf CreateSeuratObject 的输入参数，这确实有效：

nuc.seurat <- CreateSeuratObject(counts = as.matrix(UMIs), project = i, min.cells = 3)

但是，在此步骤中按 min.features 进行过滤可以减小对象大小并消除其他错误（NA 数据等）。所以这不是一个足够好的解决方案。