如何在 Linux 上的 R 中安装 terra 和 raster 库来操作 .nc 文件？-解网

问：

我正在尝试在 R 中打开和操作 .nc 文件（netcdf）。我已经设法安装了 ncdf4、RNetCDF 和 ggplot2 软件包。我的问题是，当我尝试安装其他软件包来帮助我处理我的文件时，我收到错误消息，例如“非零退出状态”（我知道这意味着它未安装），或者有关软件包不适用于我的 R 版本的消息（我有 4.1.2）。

我尝试先安装错误消息中列出的“依赖项”（在阅读了此处的建议之后）——但它们不会安装。我已经在我的 Linux 终端中输入了一个更新命令（这就是我安装 ncdf4 和 RNetCDF 的方式）。我一直在网上四处寻找答案——来自 GitHub，以及来自 David W Peirce（他为 Linux 制作了 ncview）和这个网站的指示——到目前为止还没有运气。我不太确定如何使用 ncdf4 库，但根据我的研究，我认为我还需要栅格库、terra 库以及其他一些用于空间分析的库。

我的主要问题是安装栅格和 terra 库。我已经试过了： install.packages（“栅格”）和 install.packages（“栅格”，依赖项 = TRUE）和 install.packages（“terra”）。

我最后的错误消息的一部分内容如下：

错误：包“terra”的配置失败

删除“/home/******a/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/terra” install.packages 中的警告：软件包“terra”的安装具有非零退出状态

- 重复了一堆较小的软件包，例如“units”和“sf”以及其他类似的东西（正如我之前所说，我尝试单独安装但没有成功）。如何安装 terra 和 raster？

NetCDF R-光栅 NCDF4

“我尝试先安装错误消息中列出的'依赖项'（在阅读了此处的建议之后）——但它们不会安装”——这些可能是您使用 Linux 包管理器安装到 Linux 而不是 R 中的系统依赖项。但是，如果不看到错误和您尝试过的内容，就很难分辨。例如，units 有“SystemRequirements： udunits-2”，在我的 Linux 盒子上需要或类似。或者，设置 r2u eddelbuettel.github.io/r2u 并获得二进制安装，sys deps 由 apt 神奇地处理。sudo apt install lib-udunits2-dev

0赞 Patrick 11/9/2023

你怎么知道你需要和包？你的知识似乎是不完整的，因为它是你的继承者，所以你需要一个，而不是两者兼而有之。你为什么不告诉我们你想用你的NetCDF文件做什么，可能还有其他解决方案（如包）。terrarasterterrarasterstars

答：

2赞 Dirk is no longer here 11/9/2023 #1

正如@Barry在上面的评论中提到的，r2u 可以为您提供帮助。它为 Ubuntu LTS 系统 20.04 和 22.04 增加了查询包含所有 CRAN 以及近 400 个 BioConductor 软件包的存储库的能力。另外，通过使用，您可以从 R 访问它。aptbspm

它适用于标准的 Ubuntu 笔记本电脑和服务器，或容器中，或 GitHub Actions，或可能 - 它适用于任何运行 Ubuntu LTS 的地方。

这是我刚刚用一个命令记录安装的一个快速演示 - 导致所有 50 多个必需的软件包在几秒钟内安装完毕。试一试吧！terrainstall.packages("terra")

（我没有展示，因为它已经正式退休了。R2U 仍然具有二进制文件。所以如果你这样做，你就会两者兼而有之。rasterinstall.packages(c("terra", "raster"))

上一个：安装依赖于 NetCDF 的软件时出错：我是否需要 NetCDF3 而不是 NetCDF4？

下一个：使用 R 下载 NetCDF 文件：手动工作，但下载的文件较小

如何在 Linux 上的 R 中安装 terra 和 raster 库来操作 .nc 文件？

How to install the terra and raster libraries in R on Linux to manipulate .nc files?

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