提问人:Hack-R 提问时间:1/1/2015 最后编辑:Hack-R 更新时间:1/1/2015 访问量:7298
R:找不到函数“函数(对象,...\nObject“在 glm() 和 bestglm() 中
R: could not find function "function (object, ...) \nobject" in glm() and bestglm()
问:
我正在从包中运行分析:bestglm
bestglm
res.bestglm <-
bestglm(Xy = offermodel,
family = binomial,
IC = "BIC",
method = "exhaustive")
summary(res.bestglm$BestModel)
Morgan-Tatar search since family is non-gaussian.
我开始收到这个错误:
Error in model.frame.default(formula = y ~ 1, weights = weights, drop.unused.levels = TRUE) :
could not find function "function (object, ...) \nobject"
我检查了我的模型数据,它看起来不错——正确的类,没有缺失,我以前以同样的方式使用过的变量没有问题。
在对错误进行故障排除和网络搜索失败后,我尝试了常规数据,并开始收到几乎相同的错误:glm
> glm.mba <- glm(y ~ female + DNC + SE_region + enr_before_offer + FA,
+ family = binomial(link = "probit"), data = offermodel)
Error in model.frame.default(formula = y ~ female + DNC + SE_region + :
could not find function "function (object, ...) \nobject"
我不确定如何为这个问题制作一个可重现的例子。这是我的数据结构:
> str(offermodel)
'data.frame': 2559 obs. of 10 variables:
$ online_chan : num 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ SE_region : num 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 ...
$ recruited : num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ referral : num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ FA : num 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 ...
$ female : num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ enr_before_offer: num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ reg_lag_high : num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ DNC : num 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 ...
$ y : num 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 ...
无论我的模型规范如何,以及我是否从数据帧中删除列,这个问题仍然存在,因此我不认为这是数据问题。
> traceback()
5: model.frame.default(formula = y ~ female + DNC + SE_region +
enr_before_offer + FA, data = offermodel, drop.unused.levels = TRUE)
4: stats::model.frame(formula = y ~ female + DNC + SE_region + enr_before_offer +
FA, data = offermodel, drop.unused.levels = TRUE)
3: eval(expr, envir, enclos)
2: eval(mf, parent.frame())
1: glm(y ~ female + DNC + SE_region + enr_before_offer + FA, family = binomial(link = "probit"),
data = offermodel)
在@BenBolker的建议下,我尝试了一些调试选项,并得到了更多信息:
> glm.mba <- glm(y ~ female + DNC + SE_region + enr_before_offer + FA, data = offermodel)
Error in model.frame.default(formula = y ~ female + DNC + SE_region + :
could not find function "function (object, ...) \nobject"
Enter a frame number, or 0 to exit
1: glm(y ~ female + DNC + SE_region + enr_before_offer + FA, data = offermodel)
2: eval(mf, parent.frame())
3: eval(expr, envir, enclos)
4: stats::model.frame(formula = y ~ female + DNC + SE_region + enr_before_offer + FA, data = offermodel, drop.unu
5: model.frame.default(formula = y ~ female + DNC + SE_region + enr_before_offer + FA, data = offermodel, drop.un
Selection: 5
Called from: (function ()
{
if (.isMethodsDispatchOn()) {
tState <- tracingState(FALSE)
on.exit(tracingState(tState))
}
calls <- sys.calls()
from <- 0L
n <- length(calls)
if (identical(sys.function(n), recover))
n <- n - 1L
for (i in rev(seq_len(n))) {
calli <- calls[[i]]
fname <- calli[[1L]]
if (!is.na(match(deparse(fname)[1L], c("methods::.doTrace",
".doTrace")))) {
from <- i - 1L
break
}
}
if (from == 0L)
for (i in rev(seq_len(n))) {
calli <- calls[[i]]
fname <- calli[[1L]]
if (!is.name(fname) || is.na(match(as.character(fname),
c("recover", "stop", "Stop")))) {
from <- i
break
}
}
if (from > 0L) {
if (!interactive()) {
try(dump.frames())
cat(gettext("recover called non-interactively; frames dumped, use debugger() to view\n"))
return(NULL)
}
else if (identical(getOption("show.error.messages"),
FALSE))
return(NULL)
calls <- limitedLabels(calls[1L:from])
repeat {
which <- menu(calls, title = "\nEnter a frame number, or 0 to exit ")
if (which)
eval(substitute(browser(skipCalls = skip), list(skip = 7 -
which)), envir = sys.frame(which))
else break
}
}
else cat(gettext("No suitable frames for recover()\n"))
})()
我也试过:
rm(res.bestglm) # Because of a message you can see in the comments
install.packages("bestglm")
require(bestglm)
答:
3赞
Hack-R
1/1/2015
#1
非常感谢评论中的人。
我不太确定是什么导致了这个错误,但这是修复它的方法:
- 删除了一个有问题的对象,
res.bestglm
- 重新安装
bestglm
- 保存图像并关闭项目
- 重新打开项目并加载包
我不确定为什么 #1 中的对象有问题,但它在某种程度上使全球环境变得混乱。此外,在我启动原版会话后,R 找不到,而没有先删除对象并重新安装包。bestglm
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Heisenberg
3/10/2015
重新启动 R 会话也对我有用,即使没有。rm(list=ls())
1赞
Matt Bannert
5/31/2015
遇到同样的问题。 随后的会话重启足以让我解决症状。还不知道是什么原因导致了这个问题。在传递全局环境中也存在的公式时,确实会引起混淆。rm(list=ls())
0赞
Carlos Cinelli
5/18/2017
您是否在使用 RStudio?
2赞
Carlos Cinelli
5/20/2017
@Hack还不确定,但我怀疑这是 RStudio 的错误。
1赞
coletl
2/8/2020
我只使用时遇到了同样的错误。退出 RStudio 对我有用。stats::lm()
评论
--vanilla
function
d <- data.frame(y=c(1,1,0)); glm(y~1,data=d,family=binomial(link="probit"))
bestglm
binomial
binomial
traceback()