cat peptides.txt | while read line 
do
   # do something with $line here
done

和单行变体：

cat peptides.txt | while read line; do something_with_$line_here; done

如果没有尾随换行符，这些选项将跳过文件的最后一行。

您可以通过以下方法避免这种情况：

cat peptides.txt | while read line || [[ -n $line ]];
do
   # do something with $line here
done

一种方法是：

while read p; do
  echo "$p"
done <peptides.txt

正如评论中所指出的，这有修剪前导空格、解释反斜杠序列以及如果缺少终止换行符而跳过最后一行的副作用。如果存在这些问题，您可以执行以下操作：

while IFS="" read -r p || [ -n "$p" ]
do
  printf '%s\n' "$p"
done < peptides.txt

---

在特殊情况下，如果循环正文可能从标准输入中读取，则可以使用不同的文件描述符打开文件：

while read -u 10 p; do
  ...
done 10<peptides.txt

在这里，10 只是一个任意数字（与 0、1、2 不同）。

选项 1a：While 循环：一次单行：输入重定向

#!/bin/bash
filename='peptides.txt'
echo Start
while read p; do 
    echo "$p"
done < "$filename"

选项 1b：While 循环：一次单行：
打开文件，从文件描述符读取（在本例中为文件描述符 #4）。

#!/bin/bash
filename='peptides.txt'
exec 4<"$filename"
echo Start
while read -u4 p ; do
    echo "$p"
done

注意：选项 2 已删除。忽略引用选项 2 的评论，因为它作为反模式被正确地删除了（如果您确实需要知道，请参阅编辑）

这并不比其他答案更好，但在没有空格的文件中完成工作的另一种方法（请参阅注释）。我发现我经常需要单行来挖掘文本文件中的列表，而无需使用单独的脚本文件的额外步骤。

for word in $(cat peptides.txt); do echo $word; done

这种格式允许我将其全部放在一个命令行中。将“echo $word”部分更改为您想要的任何内容，您可以发出多个用分号分隔的命令。以下示例将文件的内容用作您可能已编写的另外两个脚本的参数。

for word in $(cat peptides.txt); do cmd_a.sh $word; cmd_b.py $word; done

或者，如果您打算像流编辑器一样使用它（学习 sed），您可以将输出转储到另一个文件，如下所示。

for word in $(cat peptides.txt); do cmd_a.sh $word; cmd_b.py $word; done > outfile.txt

我使用了上面写的这些，因为我使用了文本文件，我创建了它们，每行一个单词。（见评论）如果您有不想拆分单词/行的空格，它会变得有点难看，但相同的命令仍然按如下方式工作：

OLDIFS=$IFS; IFS=$'\n'; for line in $(cat peptides.txt); do cmd_a.sh $line; cmd_b.py $line; done > outfile.txt; IFS=$OLDIFS

这只是告诉 shell 只拆分换行符，而不是空格，然后将环境恢复到以前的状态。不过，在这一点上，您可能需要考虑将其全部放入 shell 脚本中，而不是将其全部压缩到一行中。

祝你好运！

#!/bin/bash
#
# Change the file name from "test" to desired input file 
# (The comments in bash are prefixed with #'s)
for x in $(cat test.txt)
do
    echo $x
done

使用 while 循环，如下所示：

while IFS= read -r line; do
   echo "$line"
done <file

笔记：

1. 如果设置不正确，将丢失缩进。IFS

2. 您几乎总是应该将 -r 选项与 read 一起使用。

3. 不要读带有 for 的行

这是我的真实示例，如何循环另一个程序输出的行，检查子字符串，从变量中删除双引号，在循环外使用该变量。我想很多人迟早会问这些问题。

##Parse FPS from first video stream, drop quotes from fps variable
## streams.stream.0.codec_type="video"
## streams.stream.0.r_frame_rate="24000/1001"
## streams.stream.0.avg_frame_rate="24000/1001"
FPS=unknown
while read -r line; do
  if [[ $FPS == "unknown" ]] && [[ $line == *".codec_type=\"video\""* ]]; then
    echo ParseFPS $line
    FPS=parse
  fi
  if [[ $FPS == "parse" ]] && [[ $line == *".r_frame_rate="* ]]; then
    echo ParseFPS $line
    FPS=${line##*=}
    FPS="${FPS%\"}"
    FPS="${FPS#\"}"
  fi
done <<< "$(ffprobe -v quiet -print_format flat -show_format -show_streams -i "$input")"
if [ "$FPS" == "unknown" ] || [ "$FPS" == "parse" ]; then 
  echo ParseFPS Unknown frame rate
fi
echo Found $FPS

在循环外声明变量，设置值并在循环外使用它需要<<<“$（...）”语法完成。应用程序需要在当前控制台的上下文中运行。命令两边的引号保留输出流的换行符。

子字符串的循环匹配然后读取 name=value pair，拆分 last = 字符的右侧部分，删除第一个引号，删除最后一个引号，我们有一个干净的值可以在其他地方使用。

@Peter：这可能对你有用——

echo "Start!";for p in $(cat ./pep); do
echo $p
done

这将返回输出-

Start!
RKEKNVQ
IPKKLLQK
QYFHQLEKMNVK
IPKKLLQK
GDLSTALEVAIDCYEK
QYFHQLEKMNVKIPENIYR
RKEKNVQ
VLAKHGKLQDAIN
ILGFMK
LEDVALQILL

假设你有这个文件：

$ cat /tmp/test.txt
Line 1
    Line 2 has leading space
Line 3 followed by blank line

Line 5 (follows a blank line) and has trailing space    
Line 6 has no ending CR

有四个元素会改变许多 Bash 解决方案读取的文件输出的含义：

1. 空白行 4;
2. 两条线上的前导或尾随空格;
3. 保持单行的含义（即每行都是一条记录）;
4. 第 6 行未以 CR 结尾。

如果希望文本文件逐行包含空行和终止行，则必须使用 while 循环，并且必须对最后一行进行替代测试。

以下是可能更改文件的方法（与返回的内容相比）：cat

1） 丢失最后一行以及前导和尾随空格：

$ while read -r p; do printf "%s\n" "'$p'"; done </tmp/test.txt
'Line 1'
'Line 2 has leading space'
'Line 3 followed by blank line'
''
'Line 5 (follows a blank line) and has trailing space'

（如果这样做，则保留前导和尾随空格，但如果最后一行未以 CR 结尾，则仍会丢失最后一行）while IFS= read -r p; do printf "%s\n" "'$p'"; done </tmp/test.txt

2）使用带有will的进程替换可以一口气读取整个文件，并失去单个行的含义：cat

$ for p in "$(cat /tmp/test.txt)"; do printf "%s\n" "'$p'"; done
'Line 1
    Line 2 has leading space
Line 3 followed by blank line

Line 5 (follows a blank line) and has trailing space    
Line 6 has no ending CR'

（如果删除 ，则逐字阅读文件，而不是一口吞咽。也可能不是预期的......"$(cat /tmp/test.txt)

---

逐行读取文件并保留所有间距的最可靠和最简单的方法是：

$ while IFS= read -r line || [[ -n $line ]]; do printf "'%s'\n" "$line"; done </tmp/test.txt
'Line 1'
'    Line 2 has leading space'
'Line 3 followed by blank line'
''
'Line 5 (follows a blank line) and has trailing space    '
'Line 6 has no ending CR'

如果要剥离前导空格和交易空格，请删除以下部分：IFS=

$ while read -r line || [[ -n $line ]]; do printf "'%s'\n" "$line"; done </tmp/test.txt
'Line 1'
'Line 2 has leading space'
'Line 3 followed by blank line'
''
'Line 5 (follows a blank line) and has trailing space'
'Line 6 has no ending CR'

（没有终止符的文本文件虽然很常见，但在 POSIX 下被认为是损坏的。如果你能指望尾随，你就不需要在循环中。\n\n|| [[ -n $line ]]while

更多内容请见 BASH 常见问题解答

如果您不希望您的读取被换行符打断，请使用 -

#!/bin/bash
while IFS='' read -r line || [[ -n "$line" ]]; do
    echo "$line"
done < "$1"

然后以文件名作为参数运行脚本。

其他答案未涵盖的还有几件事：

从分隔文件中读取

# ':' is the delimiter here, and there are three fields on each line in the file
# IFS set below is restricted to the context of `read`, it doesn't affect any other code
while IFS=: read -r field1 field2 field3; do
  # process the fields
  # if the line has less than three fields, the missing fields will be set to an empty string
  # if the line has more than three fields, `field3` will get all the values, including the third field plus the delimiter(s)
done < input.txt

使用进程替换从另一个命令的输出中读取

while read -r line; do
  # process the line
done < <(command ...)

这种方法比因为这里的 while 循环在当前 shell 中运行，而不是像后者那样在子 shell 中运行更好。请参阅相关文章 A variable modified within a while loop is not remembered.command ... | while read -r line; do ...

例如，从空分隔的输入中读取find ... -print0

while read -r -d '' line; do
  # logic
  # use a second 'read ... <<< "$line"' if we need to tokenize the line
done < <(find /path/to/dir -print0)

相关阅读：BashFAQ/020 - 如何查找并安全地处理包含换行符、空格或两者兼而有之的文件名？

一次读取多个文件

while read -u 3 -r line1 && read -u 4 -r line2; do
  # process the lines
  # note that the loop will end when we reach EOF on either of the files, because of the `&&`
done 3< input1.txt 4< input2.txt

根据 @chepner 的回答：

-u是一个 bash 扩展。对于 POSIX 兼容性，每个调用都类似于 .read -r X <&3

将整个文件读入数组（Bash 版本早至 4）

while read -r line; do
    my_array+=("$line")
done < my_file

如果文件以不完整的行结尾（末尾缺少换行符），则：

while read -r line || [[ $line ]]; do
    my_array+=("$line")
done < my_file

将整个文件读入数组（Bash 版本 4x 及更高版本）

readarray -t my_array < my_file

或

mapfile -t my_array < my_file

然后

for line in "${my_array[@]}"; do
  # process the lines
done

• 更多关于 shell 内置的 read 和 readarray 命令 - GNU

• 有关IFS的更多信息 - 维基百科，自由的百科全书

• BashFAQ/001 - 如何逐行（和/或逐字段）读取文件（数据流、变量）？

相关文章：

• 在 Bash 中从文本文件创建数组
• 读取只有一行的文件的方法有什么区别？
• 与 cat 相比，Bash 而读取循环非常慢，为什么？

这来得相当晚，但考虑到它可能会帮助某人，我正在添加答案。此外，这可能不是最好的方法。 命令可以与参数一起使用，从文件的开头读取 N 行，同样，命令可用于从底部读取。现在，要从文件中获取第 n 行，我们以 n 行为首，将数据从管道数据中仅尾部 1 行。head-ntail

   TOTAL_LINES=`wc -l $USER_FILE | cut -d " " -f1 `
   echo $TOTAL_LINES       # To validate total lines in the file

   for (( i=1 ; i <= $TOTAL_LINES; i++ ))
   do
      LINE=`head -n$i $USER_FILE | tail -n1`
      echo $LINE
   done

我喜欢用 . 功能强大且命令行友好xargswhilexargs

cat peptides.txt | xargs -I % sh -c "echo %"

使用 ，您还可以添加详细程度 with 和 验证xargs-t-p

这可能是最简单的答案，也许它并非在所有情况下都有效，但它对我来说效果很好：

while read line;do echo "$line";done<peptides.txt

如果需要将空格括在括号中：

while read line;do echo \"$line\";done<peptides.txt

啊，这与获得最多赞成票的答案几乎相同，但它都在一行上。

使用 xargs 的另一种方式

<file_name | xargs -I {} echo {}

echo 可以替换为其他命令或进一步通过管道传输。

对于“猫肽.txt”中的 P 做 回声 “${p}” 做