分类暴露(SNP 的遗传易感性)和连续重复测量结果(抑郁症状)

Categorical exposure (genetic predisposition of a SNP) and continuous repeated measures outcome (depressive symptoms)

提问人:Ana Wenzler 提问时间:3/31/2023 最后编辑:Ana Wenzler 更新时间:4/3/2023 访问量:11

问:

我正在以下问题上寻求一些帮助。 我必须分析SNPs与抑郁症状之间的关联。SNP 的遗传易感性将被归类为 0,1 或 2 个次要等位基因(暴露变量)。抑郁症状将随着时间的推移(T0、T1、T2、T3)进行测量,并在 0-60 分之间保持连续。首先,我想评估这种关联,然后我可能想要调整年龄、性别、BMI。

我最初的困难是线性模型,但是我不会测量随时间的变化。所以我的第二个想法是混合线性模型。然而,我遇到了一个问题,即我将研究个体之间的差异,而不是遗传易感性之间的差异。有没有办法使用 lme4(如果抑郁症状有偏差,则使用 gglme)对遗传易感性进行分层或直接查看遗传易感性对抑郁症状的影响?

我的另一个想法是忽略参与者的ID号,并将其分析为: lmer(depressive_symptoms~1 + (1|SNP), data=df) ->这有意义吗?如果我这样做,我会得到非常奇怪的情节。

我希望有人能帮助我。(我还没有脚本/数据库或结果,因为我正在为提案编写分析计划,所以我不能包含任何内容。

**我的问题是:最好使用什么型号?**

提前致谢,

我试图在书籍、网站等中查找它,但我只能在个人之间找到它。

时间 LME4 连续 纵向分类

评论

0赞 Chris 4/3/2023
欢迎来到 Stack Overflow。请阅读为什么“有人可以帮助我吗?”不是一个实际的问题?
0赞 Community 4/3/2023
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答: 暂无答案