提问人:Sebastián 提问时间:11/3/2023 更新时间:11/3/2023 访问量:44
iGraph R 中的合约顶点保留所有节点属性?
contract vertices in igraph r preserving all nodes attributes?
问:
我需要合并图形的几个顶点。我使用了 igraph 函数,它运行良好,但不允许我获取原始类型数据。此外,该函数不会删除折叠的顶点(在示例中为 4 和 8)。contract
G <- graph.ring(10)
V(G)$character <- rep(c("attr1","attr2"),5)
V(G)$numeric <- rep(1:5,2)
V(G)$newId <- c(1,2,3,3,5,6,7,7,9,10)
G1 <- contract(G, V(G)$newId, vertex.attr.comb = toString)
par(mfrow=c(1,2))
plot(G)
plot(G1)
除了对折叠顶点的值进行分组外,结果还仅生成字符格式值。我尝试了vertex.attr.comb的不同选项。因为我有字符和数字数据,所以总和选项不起作用,“first”或“last”不会保留所有数据。其他选项(如列出所有属性)不起作用。
因此,我不知道如何为每个顶点获取单个值而不是两个或多个值,也不知道如何操作获得的值。
此外,我必须删除折叠的顶点。就我而言,我可以用 来做到这一点,但是当它们打算与原始网络隔离时,这似乎不是理想的解决方案。
提前致谢。delete.vertices (G,V(KeyW)[degree(G)==0)
答:
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ThomasIsCoding
11/3/2023
#1
更新
如果要对每个节点的属性进行一些额外的操作,可以使用如下方法lapply
V(G1)$numeric <- unlist(lapply(V(G1)$numeric, sum))
您将获得
> V(G1)$numeric
[1] 1 2 7 0 5 1 5 0 4 5
contract
图形和换行属性
我想您可以尝试连接属性,例如,vertex.attr.comb = c
G1 <- contract(G, V(G)$newId, vertex.attr.comb = c)
并且 的属性保存在一个列表中,例如,G1
> str(V(G1)$character)
List of 10
$ : chr "attr1"
$ : chr "attr2"
$ : chr [1:2] "attr1" "attr2"
$ : chr(0)
$ : chr "attr1"
$ : chr "attr2"
$ : chr [1:2] "attr1" "attr2"
$ : chr(0)
$ : chr "attr1"
$ : chr "attr2"
> str(V(G1)$numeric)
List of 10
$ : int 1
$ : int 2
$ : int [1:2] 3 4
$ : int(0)
$ : int 5
$ : int 1
$ : int [1:2] 2 3
$ : int(0)
$ : int 4
$ : int 5
> str(V(G1)$newId)
List of 10
$ : num 1
$ : num 2
$ : num [1:2] 3 3
$ : num(0)
$ : num 5
$ : num 6
$ : num [1:2] 7 7
$ : num(0)
$ : num 9
$ : num 10
评论
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Sebastián
11/3/2023
谢谢托马斯,但是在顶点折叠的情况下,我如何获得总和或第一个值?我尝试了以下表达式,但它返回了以前的数据(分配给折叠的顶点)。''' V(G1)$numeric 2 <- as.numeric(unlist(V(G1)$numeric)) '''
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ThomasIsCoding
11/3/2023
@Sebastián 查看我的更新
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Sebastián
11/3/2023
谢谢@ThomasIsCoding。有了这些信息,你还可以消除值为 0 的顶点(只要其他顶点的总和不同于 0,否则一个简单的方法是在合约函数之前添加一个常量)。
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