提问人:hirolau 提问时间:6/13/2013 最后编辑:David Arenburghirolau 更新时间:3/22/2023 访问量:187435
安装旧版本的 R 包
Installing older version of R package
问:
我正在尝试使用 Rpy2 和 ggplot2,但出现错误。在网上搜索错误后,我发现发生错误是因为 ggplot2 包中有一些更改尚未反映在 Rpy2 中(例如,请参阅此帖子(编辑:链接现已失效))。
所以我现在需要安装旧版本的 ggplot2。这是我想要的伪代码:
install.packages("ggplot2", version='0.9.1')
但是 install.packages
没有 version
参数。我该怎么做?
答:
若要从源代码(在 R 中)安装较旧版本的包,请执行以下操作:
packageurl <- "http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_0.9.1.tar.gz"
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")
如果这对您不起作用,并且您使用的是 Windows,原因可能是缺乏用于构建/编译包的适当工具链。通常,您会从 CRAN 安装预编译的二进制文件,但它们只存档包源,而不是二进制文件。[1] 这意味着您需要安装 Rtools,以便您可以在本地编译所有内容。(注意:Rtools 不是 R 包。
@shadow下面的回答也说明了您可以使用 .这也是一个好主意,但也需要在 Windows 上使用 Rtools。devtools::install_version()
截至 2015 年 9 月 18 日,CRAN 上出现了新的软件包版本。这依赖于 Revolution Analytics MRAN 服务器来安装特定版本或日期的软件包:
# install yesterday's version of checkpoint, by date
install.dates('checkpoint', Sys.Date() - 1)
# install earlier versions of checkpoint and devtools
install.versions(c('checkpoint', 'devtools'), c('0.3.3', '1.6.1'))
这样做的好处是不需要 Rtools 在 Windows 上安装二进制包,但只能追溯到 2014 年 9 月 17 日(MRAN 启动时)。
若要从命令行(在 R 外部)安装旧版本,请执行以下操作:
一旦你的机器上本地有了包源(“tarball”),你也可以在命令行(终端、命令提示符等)上使用来安装包,例如使用(如果你有的话):R CMD INSTALL
wget
wget http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_0.9.1.tar.gz
或者,如果你使用的是 Windows,则使用 PowerShell 的等效项为:
(new-object System.Net.WebClient).DownloadFile("http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_0.9.1.tar.gz", "./ggplot2_0.9.1.tar.gz")
或者您可以通过网络浏览器从 CRAN 存档下载源代码。
要从本地文件安装,您可以执行以下操作:
R CMD INSTALL ggplot2_0.9.1.tar.gz
这应该适用于任何平台(与上面相同的警告 - 关于需要一个工具链来构建包)。
[1]这已不完全正确。从 2016 年 3 月开始,CRAN 开始托管“CRAN 存档”服务器,其中包含非常旧版本的 R(> 5 年)的 Windows 和 Mac 二进制文件。您现在可以使用 install.packages()
直接从此服务器安装。有关详细信息,请参阅新的 R 常见问题解答 7.44。
评论
Warning message: package ‘http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_0.9.1.tar.gz’ is not available (for R version 2.15.2)
按照另一个答案中的说明使用对我不起作用。install.packages
我发现的最好的选择是使用包中的函数。install_url
devtools
我没有进一步探讨的另一种可能性:
- 从包存档中下载较旧的 .tar.gz 源文件。
- 按照 http://rtm.wustl.edu/writings/htrtargz.pdf 上记录的步骤在本地安装它。
评论
R CMD INSTALL
该软件包提供了一个可以直接执行此操作的功能。remotes
install_version
require(remotes)
install_version("ggplot2", version = "0.9.1", repos = "http://cran.us.r-project.org")
以前,此答案指向包,该包也重新导出了该函数。感谢@MichaelChirico指出该软件包更可取。devtools
install_version
remotes
评论
install_version
library(ggplot2-0.9.1)
install_version('ggplot2', version = 0.9.1, lib = 'path_to_library_with_ggplot_0.9.1')
library(ggplot2, lib.loc = 'path_to_library_with_ggplot_0.9.1')
您可以从下面的链接以 zip 文件的形式下载相应的版本。
http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/
在 R Studio 中: 工具 >> 安装包 >> 安装自:(选择下拉列表)
包存档文件(.zip,.tar.gz)。
选择新下载的 package-zip-file 并安装软件包
找到了一个很好的解决方案,对我有用(详细信息在链接中)。
“repmis”库中的命令:
# Install old versions of the e1071 and gtools packages.
# Create vectors of the package names and versions to install
# Note the names and version numbers must be in the same order
Names <- c("e1071", "gtools")
Vers <- c("1.6", "2.6.1")
# Install old package versions into the default library
InstallOldPackages(pkgs = Names, versions = Vers)
纯法install.packages
请参阅 r-devel 邮件列表上的此主题。在回复 Kurt Wheeler 时,Kurt Hornik 透露了 CRAN 网站的一个未记录的功能,用于指定软件包的特定版本。
只要你已经安装了所有必需的依赖项,这个方法就会起作用:
package = "https://cran.r-project.org/package=svglite&version=1.2.1"
utils::install.packages(pkgs = package, repos = NULL)
请注意上面的 URL 结构。这解决了最新版本的 CRAN 与存档版本的 URL 结构不同的问题:
# Latest version (not available at Archive/svglite)
https://cran.r-project.org/src/contrib/svglite_1.2.1.tar.gz
# Archived version
https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/svglite/svglite_1.2.0.tar.gz
remotes::install_version
方法
另一种选择是使用该函数。但是,您将需要安装该软件包。remotes::install_version
remotes
评论
对于自 2014 年 9 月 17 日以来发布的软件包版本,有一个版本
包可以大大简化此任务。它使用 Revolution Analytics 的 MRAN 服务器快照来:
显示任何 CRAN 软件包的发布日期和 MRAN 可用性 (),
available.versions
安装一个或多个 packages() 的指定版本,或者
install.versions
安装自任何指定日期 () 起可用的软件包版本。它通过标准功能从 MRAN 服务器进行安装,因此可以安装可用的二进制版本,而不必从源代码编译,并且可以包含截至指定日期的包依赖项。
install.dates
install.packages
当然,包版本和 R 版本的组合可能存在兼容性问题。有关运行不同 R 版本的信息,请参阅此页面。
另一种选择是 {groundhog} 包。它通过指定日期来帮助从 CRAN 安装较旧的软件包版本。当人们不记得特定的包版本,而是记住脚本仍在工作的时间时,这尤其有用。在{ggplot2}的情况下,版本0.9.1于2012年5月加载到CRAN上,因此我们可以从6月开始计算日期。
library("groundhog")
groundhog.library("ggplot2", "2012-06-01")
评论
checkBuilt