基于值向量的数据框中的子集行

Subset rows in a data frame based on a vector of values

提问人:Zelbinian 提问时间:3/5/2013 最后编辑:HenrikZelbinian 更新时间:3/24/2021 访问量:185176

问:

我有两个数据集,它们的大小应该相同,但事实并非如此。我需要修剪 A 中不在 B 中的值,反之亦然,以消除进入报表的图形中的噪声。(别担心,这些数据不会被永久删除!

我已阅读以下内容:

但我仍然无法让它正常工作。这是我的代码:

bg2011missingFromBeg <- setdiff(x=eg2011$ID, y=bg2011$ID)
#attempt 1
eg2011cleaned <- subset(eg2011, ID != bg2011missingFromBeg)
#attempt 2
eg2011cleaned <- eg2011[!eg2011$ID %in% bg2011missingFromBeg]

第一次尝试只是消除生成的 setdiff 向量中的第一个值。第二次尝试产生和笨拙的错误:

Error in `[.data.frame`(eg2012, !eg2012$ID %in% bg2012missingFromBeg) 
:  undefined columns selected
子集 R-FAQ

评论

0赞 Zelbinian 3/5/2013
我认为这里不合适。我不希望数据集被合并。merge
10赞 joran 3/5/2013
不,我认为这是完全合适的。内部联接将仅提供同时位于 A 和 B 中的行。然后,如果合并添加了任何无关的列,则可以对结果的列进行子集化。merge
0赞 Zelbinian 3/5/2013
这为我提供了适当的行数,但同样,我只剩下一个数据集。此外,从某种角度来看,这个数据集比我开始的数据集更脏——我有一个数据集,其中有几行来自“End”,一些行来自“Beg”,我不知道哪个是哪个。
0赞 joran 3/6/2013
你的第一个担忧是错误的。调用 merge 不会对两个原始数据帧执行任何操作。因此,您可以执行类似 .获得正确的列并不比假设没有重复的列更难。但是,如果您真的只在一列上匹配,那么 adibender 的解决方案可能更适合您的目的。A <- merge(A,B)merge(A,B)[,colnames(A)]
2赞 joran 3/6/2013
看,我同意,在您的情况下,只有一个索引列,合并不是最简单的选择。但是,如果您花时间使用它,您会发现它很有可能用于此目的。重复列的名称后附加了 或 .y',以便您可以知道它们来自哪个原始数据框。这需要 1-2 行额外的代码,但使用就可以了。.xmerge

答:

86赞 adibender 3/5/2013 #1

这将为您提供您想要的东西:

eg2011cleaned <- eg2011[!eg2011$ID %in% bg2011missingFromBeg, ]

第二次尝试中的错误是因为你忘记了,

通常,为方便起见,规范将列子集用于 2d .如果要子集行并保留所有列,则必须使用规范,而可以留空,默认情况下将使用所有列。object[index]objectobject[index_rows, index_columns]index_cols

但是,您仍然需要包含 以指示要获取行的子集而不是列的子集。,

评论

0赞 Zelbinian 3/5/2013
是的,这解决了问题。不过,我会等待其他答案,以防万一有人想出一些非常聪明的东西。:)
1赞 Señor O 3/5/2013
subset如果将逻辑语句更改为subset(eg2011, !ID %in% bg2011missingFromBeg)
0赞 Dinre 3/5/2013
这和我写的答案真的是一样的。选择adibender的答案,因为它直接解决了你的问题。我只是为其他人添加了我的,以便他们以后偶然发现此页面时能够用作更强大的参考。
0赞 JaKu 2/2/2017
对于更快的“data.table”也是如此
17赞 Dinre 3/5/2013 #2

如果你真的只想通过两个数据框中都存在的索引来子集每个数据框,你可以使用“match”函数来做到这一点,如下所示:

data_A[match(data_B$index, data_A$index, nomatch=0),]
data_B[match(data_A$index, data_B$index, nomatch=0),]

不过,这与以下相同:

data_A[data_A$index %in% data_B$index,]
data_B[data_B$index %in% data_A$index,]

下面是一个演示:

# Set seed for reproducibility.
set.seed(1)

# Create two sample data sets.
data_A <- data.frame(index=sample(1:200, 90, rep=FALSE), value=runif(90))
data_B <- data.frame(index=sample(1:200, 120, rep=FALSE), value=runif(120))

# Subset data of each data frame by the index in the other.
t_A <- data_A[match(data_B$index, data_A$index, nomatch=0),]
t_B <- data_B[match(data_A$index, data_B$index, nomatch=0),]

# Make sure they match.
data.frame(t_A[order(t_A$index),], t_B[order(t_B$index),])[1:20,]

#    index     value index.1    value.1
# 27     3 0.7155661       3 0.65887761
# 10    12 0.6049333      12 0.14362694
# 88    14 0.7410786      14 0.42021589
# 56    15 0.4525708      15 0.78101754
# 38    18 0.2075451      18 0.70277874
# 24    23 0.4314737      23 0.78218212
# 34    32 0.1734423      32 0.85508236
# 22    38 0.7317925      38 0.56426384
# 84    39 0.3913593      39 0.09485786
# 5     40 0.7789147      40 0.31248966
# 74    43 0.7799849      43 0.10910096
# 71    45 0.2847905      45 0.26787813
# 57    46 0.1751268      46 0.17719454
# 25    48 0.1482116      48 0.99607737
# 81    53 0.6304141      53 0.26721208
# 60    58 0.8645449      58 0.96920881
# 30    59 0.6401010      59 0.67371223
# 75    61 0.8806190      61 0.69882454
# 63    64 0.3287773      64 0.36918946
# 19    70 0.9240745      70 0.11350771

评论

0赞 Zelbinian 3/6/2013
让我看看我能不能用语言重复一遍。根据索引,给我data_A中同时位于 data_A 和 data_B 中的所有行。我说得对吗?data_A[data_A$index %in% data_B$index,]
4赞 Dinre 3/6/2013
@Zelbinian 具体来说,它说:给我data_A中的所有行,其中 data_A 行的索引值可以在 data_B 中的索引值中找到。这是一个略有不同的陈述,但你基本上是正确的。唯一的区别是,我们特别需要 data_A 中的行号。如果反转语句,它将无法正常工作。
0赞 Sam Firke 4/1/2015
很好的可重现示例+解释。
3赞 Sam Firke 4/1/2015 #3

根据对原始帖子的评论,合并/联接非常适合这个问题。具体而言,内部联接将仅返回两个 DataFrame 中都存在的值,因此不需要该语句。setdiff

使用 Dinre 示例中的数据:

在基础 R 中:

cleanedA <- merge(data_A, data_B[, "index"], by = 1, sort = FALSE)
cleanedB <- merge(data_B, data_A[, "index"], by = 1, sort = FALSE)

使用 dplyr 软件包:

library(dplyr)
cleanedA <- inner_join(data_A, data_B %>% select(index))
cleanedB <- inner_join(data_B, data_A %>% select(index))

为了将数据保留为两个单独的表,每个表仅包含自己的变量,这会在联接之前将不需要的表子集仅为其索引变量。然后,不会将新变量添加到生成的表中。

6赞 maycca 4/14/2016 #4

真正人类可以理解的例子(因为这是我第一次使用 %in%),如何比较两个数据帧并在特定列中仅保留包含相等值的行:

# Set seed for reproducibility.
set.seed(1)

# Create two sample data frames.
data_A <- data.frame(id=c(1,2,3), value=c(1,2,3))
data_B <- data.frame(id=c(1,2,3,4), value=c(5,6,7,8))

# compare data frames by specific columns and keep only 
# the rows with equal values 
data_A[data_A$id %in% data_B$id,]   # will keep data in data_A
data_B[data_B$id %in% data_A$id,]   # will keep data in data_b

结果:

> data_A[data_A$id %in% data_B$id,]
  id value
1  1     1
2  2     2
3  3     3

> data_B[data_B$id %in% data_A$id,]
  id value
1  1     5
2  2     6
3  3     7