提问人:Natasha 提问时间:5/3/2020 最后编辑:Natasha 更新时间:5/4/2020 访问量:487
计算 2D 图像中树枝的粗细
Computing the thickness of branches in a 2D image
问:
我想测量图像中树枝的粗细。以下是从斐济获得的输出。
我想计算与每条边相关的厚度的平均测量值。通过边缘,我的意思是存在于任意两个分支点之间的线段。
任何关于如何进行的指示都将非常有帮助。
图片来源:ref
编辑: 节点是交接点或端点。如果不清楚,请告诉我,如果我必须进一步解释。例如,如果我们像这里所示的那样对上面的图像进行骨架化,则交汇点或端点将是节点。如果有帮助,我可以分享上图的镂空版本。
{1 -> {36.4156, 23.8112, 0.},
2 -> {83.4779, 151.809, 0.},
3 -> {182.451, 145.504, 0.},
4 -> {227.385, 86.2469, 0.},
5 -> {311.9, 218.811, 0.},
6 -> {483.204, 190.795, 0.},
7 -> {601.916, 226.427, 0.},
8 -> {780.405, 312.889, 0.},
9 -> {974.959, 274.093, 0.},
10 -> {656.313, 209.944, 0.},
11 -> {815.08, 182.186, 0.},
12 -> {923.162, 121.453, 0.},
13 -> {353.554, 34.5667, 0.},
14 -> {479.314, 87.3631, 0.},
15 -> {662.5, 119.5, 0.},
16 -> {759.72, 99.8905, 0.},
17 -> {539.501, 34.4999, 0.},
18 -> {712.917, 26.8174, 0.},
19 -> {896.5, 65.5, 0.},
20 -> {143.654, 379.583, 0.},
21 -> {203.382, 270.926, 0.},
22 -> {311.084, 354.623, 0.},
23 -> {495.5, 330.5, 0.},
24 -> {643.872, 319.37, 0.},
25 -> {794.571, 405.533, 0.},
26 -> {415.864, 397.252, 0.},
27 -> {624.794, 369.389, 0.},
28 -> {488.5, 276.5, 0.}}
答:
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Alex Alex
5/3/2020
#1
你可以做距离变换。 将生成的图像乘以骨架。请参阅示例。将骨架分解为多个段,并在段上取平均值。这将是平均线粗细。 Matlab/Octave 代码:
a=imread('IW.png');
bw=im2bw(a, 0.1);
skeleton=bwmorph(bw, 'skel', Inf);
D = bwdist(~bw);
imagesc(D.*single(skeleton));
或者这个 Matlab/Octave 代码:
a=imread('IW.png');
bw=im2bw(a, 0.1);
skeleton=bwmorph(bw, 'skel', Inf);
branchpoints=bwmorph(skeleton, 'branchpoints');
se=strel('disk', 3);
branchpoints=imdilate(branchpoints,se);
segments=skeleton>branchpoints;
segments=bwareaopen(segments, 8);
stats = regionprops(segments,'Centroid', 'PixelIdxList');
centroids = cat(1, stats.Centroid);
D = bwdist(~bw);
hold on
%imagesc(D.*single(skeleton))
imshow(a)
for i=1:numel(stats)
m(i)=mean(D(stats(i).PixelIdxList));
text(centroids(i,1),centroids(i,2), num2str(m(i)), 'Color','blue');
end
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Natasha
5/3/2020
谢谢。我正在寻找的是颜色的平均值/每个分支的主要颜色(分支是两个交汇点之间的段)。最后,我想为每个分支分配一个颜色值。如果我的理解是正确的,上面发布的图片已经有了。我们可以将此结果转换为带有边缘标签(例如边缘 1-2 颜色代码 6.5)和颜色的表格吗?
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Alex Alex
5/4/2020
首先,您需要将骨架切成段。这可以通过 XOR 操作(骨架,“分支点”)来完成。然后,您需要遍历连接的组件并计算该段的平均值。
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Natasha
5/4/2020
非常感谢您的提示。您能否就如何做到这一点提供一些建议?First you need to cut the skeleton into segments
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Natasha
5/4/2020
谢谢。出于某种原因,当我在 2019b 中运行上述代码时,我只发现一个黑白图像,上面显示文本。您使用的是 2020a 吗?如果是,您能否告诉我如何在 2019b 中获得与上面所示相同的输出?
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Alex Alex
5/4/2020
版本 2017b。你换了第一行?文件名正确吗?从分步调试模式开始。
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