Cobalt 和 MatchThem:插补后分析

Cobalt and MatchThem: Post Imputation analysis

提问人:George 提问时间:11/18/2023 更新时间:11/18/2023 访问量:16

问:

我正在通过 MatchThem 和 Cobalt 使用带有多重插补的倾向分数匹配来执行平衡功能。在我的学科中,在 psm 研究中,习惯上提供一个表格,其中包含匹配前和匹配后每个变量的治疗组(即暴露和对照)的平均值。Cobalt 似乎没有通过插补数据集提供此类信息,坦率地说,我很惊讶。所以,对我来说,这意味着我将不得不自己访问数据并执行鲁宾规则。我可以访问匹配数据集的插补数据,但我继续遇到的问题是无法将资产负债表(即 bal.tab)的结果转换为可行的数据框。bal.tab 提供的列表不能被强制到一个可行的数据框中。有没有人对如何进行这种胁迫有任何想法?我是否在MICE或MatchThem中遗漏了可能能够做到这一点的东西?这是我正在使用的最小可行代码:

require(mice) 
require(MatchThem) 
require(cobalt)
require(survey)
require(marginaleffects)
require(dplyr)

#data for use-------------------------------------------------------------------
data('osteoarthritis')

#summary checking for missing values--------------------------------------------
summary(osteoarthritis)

mean(osteoarthritis$AGE)

#imputing the missing values using pmm via mice---------------------------------
imputed.datasets<-mice(osteoarthritis,m=5)

#performing the matching--------------------------------------------------------
matched.datasets<-matchthem(OSP~AGE+SEX+BMI+RAC+SMK, 
                            datasets=imputed.datasets, 
                            method='nearest', 
                            distance = 'logit', 
                            caliper = .20)


#gets the means for each dataset into a list
bal<-bal.tab(matched.datasets, which.imp=.all, disp=c("means"))
bal

#my attempt to coerce into a data frame
df <- ldply (bal, data.frame, optional = TRUE)
View(df)

R 回归匹配 倾向得分匹配 因果关系

评论

0赞 Noah 11/21/2023
是否习惯于在与乘法插补数据匹配之前和之后提供协变量均值表?如果有明显的方法可以做到这一点,请告诉我,我会考虑将其添加到 .cobalt
0赞 George 11/21/2023
我在社会学和犯罪学文献中遇到过这一点。我问了这个问题,因为它对我来说也不明显。澄清一下,匹配前的均值不是插补的,而是匹配后的均值是插补的。在我看来,可以使用以下方法获得变量的方法:1)对象<-complete(matched.datasets,action=“long”,all=FALSE);2)遵循鲁宾的手段规则。这行得通吗?因为点估计并不像精确估计那样受到多重插补的困扰,所以这是否是一种可能性?
0赞 Noah 11/22/2023
这可能有效,也是我通常做的事情,但目前尚不清楚这对标准差、中位数或 IQR 的效果如何,有时也会报告这些情况。这些都不适合像手段那样汇集。
0赞 George 11/23/2023
100% 同意。我并不声称了解 SD、中位数或 IQR 是如何工作的。我的主要关注点是手段,但我可以看到一个潜在的审稿人出于某种原因要求它们。通常,正如我昨天所描述的那样,前后匹配意味着在许多情况下,表格中的标准化偏差或差异会安抚大多数审稿人。自私地说,这是我的重点——手段。感谢您对手段的肯定。

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