如何使用 nlme 函数为 R 中的嵌套图建立非线性混合效应模型?

How to set up a non-linear mixed effects model for nested plots in R using nlme function?

提问人:Forester_Dipak 提问时间:8/7/2023 更新时间:8/7/2023 访问量:18

问:

我想拟合一个模型来预测形成层年龄的环密度。我有来自嵌套设计的数据;2个样地,每个样地4个间伐处理,5个重复(4*5样地),每个样地4个树类。因此,我想拟合一个非线性混合效应模型,将形成层年龄作为固定效应,将嵌套设计(场地、处理、树类)作为随机效应。我知道如何拟合 LMM,但无法用 R 为具有三个随机因素的 NLMM 编写正确的代码。任何潜在客户将不胜感激。

tibble [26,508 × 20] (S3: tbl_df/tbl/data.frame) $ Plot_id : logi [1:26508] NA NA NA NA NA NA ... $ Treatments: chr [1:26508] "100" "100" "100" "100" ... $ Tree_class: chr [1:26508] "Codominant" "Codominant" "Codominant" "Codominant" ... $ Tree_id : chr [1:26508] "CDHU9" "CDHU9" "CDHU9" "CDHU9" ... $ Disc_id : chr [1:26508] "0" "0" "0" "0" ... $ Path_id: num [1:26508] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... $ Ring_no: num [1:26508] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ... $ year: num [1:26508] 1992 1993 1994 1995 1996 ... $ Dmean: num [1:26508] 0.542 0.525 0.528 0.463 0.46 ... $ ringAge : num [1:26508] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...

模型 效应 混合 非线性

评论

0赞 Community 8/8/2023
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