为每个连续序列创建一个组号

Create a group number for each consecutive sequence

提问人:Susanne Dreisigacker 提问时间:4/14/2012 最后编辑:HenrikSusanne Dreisigacker 更新时间:5/5/2023 访问量:599725

问:

我在下面有data.frame。我想添加一个列“g”,根据列中的连续序列对我的数据进行分类。也就是说,h_no的第一个序列是第 1 组,第二个序列(1 到 7)是第 2 组,依此类推,如最后一列“g”所示。h_no1, 2, 3, 4h_no

h_no   h_freq    h_freqsq g
1     0.09091 0.008264628 1
2     0.00000 0.000000000 1
3     0.04545 0.002065702 1
4     0.00000 0.000000000 1  
1     0.13636 0.018594050 2
2     0.00000 0.000000000 2
3     0.00000 0.000000000 2
4     0.04545 0.002065702 2
5     0.31818 0.101238512 2
6     0.00000 0.000000000 2
7     0.50000 0.250000000 2 
1     0.13636 0.018594050 3 
2     0.09091 0.008264628 3
3     0.40909 0.167354628 3
4     0.04545 0.002065702 3
R 数据帧 序列

评论

0赞 Henrik 3/28/2021
另请参阅为连续序列和拆分向量创建分组变量

答:

158赞 Roman Luštrik 4/14/2012 #1

您可以使用各种技术向数据添加列。以下引文来自相关帮助文本的“详细信息”部分。[[.data.frame

可以在多种模式下对数据框进行索引。当 和 与单个向量索引 ( 或 ) 一起使用时,它们会像索引列表一样索引数据框。[[[x[i]x[[i]]

my.dataframe["new.col"] <- a.vector
my.dataframe[["new.col"]] <- a.vector

的 data.frame 方法视为列表$x

my.dataframe$new.col <- a.vector

当 和 与两个索引 ( 和 ) 一起使用时,它们的作用类似于索引矩阵[[[x[i, j]x[[i, j]]

my.dataframe[ , "new.col"] <- a.vector

由于该方法假定,如果您不指定您使用的是列还是行,它将假定您的意思是列。data.frame


对于您的示例,这应该有效:

# make some fake data
your.df <- data.frame(no = c(1:4, 1:7, 1:5), h_freq = runif(16), h_freqsq = runif(16))

# find where one appears and 
from <- which(your.df$no == 1)
to <- c((from-1)[-1], nrow(your.df)) # up to which point the sequence runs

# generate a sequence (len) and based on its length, repeat a consecutive number len times
get.seq <- mapply(from, to, 1:length(from), FUN = function(x, y, z) {
            len <- length(seq(from = x[1], to = y[1]))
            return(rep(z, times = len))
         })

# when we unlist, we get a vector
your.df$group <- unlist(get.seq)
# and append it to your original data.frame. since this is
# designating a group, it makes sense to make it a factor
your.df$group <- as.factor(your.df$group)


   no     h_freq   h_freqsq group
1   1 0.40998238 0.06463876     1
2   2 0.98086928 0.33093795     1
3   3 0.28908651 0.74077119     1
4   4 0.10476768 0.56784786     1
5   1 0.75478995 0.60479945     2
6   2 0.26974011 0.95231761     2
7   3 0.53676266 0.74370154     2
8   4 0.99784066 0.37499294     2
9   5 0.89771767 0.83467805     2
10  6 0.05363139 0.32066178     2
11  7 0.71741529 0.84572717     2
12  1 0.10654430 0.32917711     3
13  2 0.41971959 0.87155514     3
14  3 0.32432646 0.65789294     3
15  4 0.77896780 0.27599187     3
16  5 0.06100008 0.55399326     3

评论

0赞 huon 4/14/2012
最后两种添加列的方法有什么区别?
2赞 Roman Luštrik 5/5/2015
@huon-dbaupp 带有逗号的方法是显式的,也适用于矩阵,而最后一个方法仅适用于 data.frames。如果未提供逗号,则 R 假定您指的是列。
2赞 Paul Hiemstra 4/14/2012 #2

除了罗曼的回答之外,这样的事情可能更简单。请注意,我还没有测试它,因为我现在无法访问 R。

# Note that I use a global variable here
# normally not advisable, but I liked the
# use here to make the code shorter
index <<- 0
new_column = sapply(df$h_no, function(x) {
  if(x == 1) index = index + 1
  return(index)
})

该函数循环访问中的值,并始终返回当前值所属的分类。如果检测到值 ,则增加全局变量并继续。n_ho1index

评论

0赞 Roman Luštrik 4/15/2012
我喜欢带有全局变量的黑客。所以 Cish。:P
7赞 huon 4/14/2012 #3

如果我正确理解了这个问题,您想检测何时没有增加,然后增加 .(我将介绍我是如何解决这个问题的,最后有一个独立的函数。h_noclass

加工

我们目前只关心列,因此我们可以从数据框中提取它:h_no

> h_no <- data$h_no

我们想检测何时不上升,这可以通过计算连续元素之间的差异何时为负或零来做到这一点。R 提供了 diff 函数,它为我们提供了差异的向量:h_no

> d.h_no <- diff(h_no)
> d.h_no
 [1]  1  1  1 -3  1  1  1  1  1  1 -6  1  1  1

一旦我们有了这些,找到那些非积极的就很简单了:

> nonpos <- d.h_no <= 0
> nonpos
 [1] FALSE FALSE FALSE  TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE  TRUE FALSE
[13] FALSE FALSE

在 R 中,和 与 和 基本相同,因此如果我们得到 的累积和,它将在(几乎)适当的点中增加 1。cumsum 函数(基本上与 相反)可以做到这一点。TRUEFALSE10nonposdiff

> cumsum(nonpos)
 [1] 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2

但是,有两个问题:数字太小了;而且,我们缺少第一个元素(第一类应该有四个)。

第一个问题很简单:。第二个只需要在向量的前面添加 a,因为第一个元素总是在类中:1+cumsum(nonpos)11

 > classes <- c(1, 1 + cumsum(nonpos))
 > classes
  [1] 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 3

现在,我们可以使用 cbind 将其附加回数据框(通过使用语法,我们可以为列提供标题):class=class

 > data_w_classes <- cbind(data, class=classes)

现在包含结果。data_w_classes

最终结果

我们可以将这些行压缩在一起,并将它们全部包装成一个函数,使其更易于使用:

classify <- function(data) {
   cbind(data, class=c(1, 1 + cumsum(diff(data$h_no) <= 0)))
}

或者,既然 to 是一个因素是有道理的:class

classify <- function(data) {
   cbind(data, class=factor(c(1, 1 + cumsum(diff(data$h_no) <= 0))))
}

您可以使用以下任一函数:

> classified <- classify(data) # doesn't overwrite data
> data <- classify(data) # data now has the "class" column

(这种解决这个问题的方法很好,因为它避免了显式迭代,这通常推荐用于 R,并且避免生成大量中间向量和列表等。而且它如何写在一行上也有点整洁:))

13赞 user1333396 4/14/2012 #4

简单:您的数据框是 A

b <- A[,1]
b <- b==1
b <- cumsum(b)

然后你得到 b 列。

评论

0赞 A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1 4/15/2012
又好又短。我只会更改最后一个元素,以便将结果作为列直接添加到原始数据框中,例如 .cumsum(b) -> bA$groups <- cumsum(b)
0赞 Roman Luštrik 4/15/2012
cumsum(b)会给你一个长度为 3 的向量,还是我遗漏了什么?
0赞 A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1 4/17/2012
@RomanLuštrik,请参阅 dbaupp 的解决方案,其中解释了 cumsum 在这种情况下的工作原理。
2赞 A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1 4/17/2012
@RomanLuštrik,这个解决方案可以在一行中很好地重写。使用您的数据,您可以简单地获取新的组列。your.dfyour.df$group = cumsum(your.df[, 1]==1)
-1赞 user2759975 9/11/2013 #5
Data.frame[,'h_new_column'] <- as.integer(Data.frame[,'h_no'], breaks=c(1, 4, 7))
0赞 Emanuele Catania 10/1/2018 #6

我相信使用“cbind”是在 R 中向数据框添加列的最简单方法。 下面举个例子:

    myDf = data.frame(index=seq(1,10,1), Val=seq(1,10,1))
    newCol= seq(2,20,2)
    myDf = cbind(myDf,newCol)
0赞 Ferroao 12/15/2018 #7

基于识别组数 ( in ) 及其长度 ( in ) 的方法xmapplyymapply)

mytb<-read.table(text="h_no  h_freq  h_freqsq group
1     0.09091 0.008264628 1
2     0.00000 0.000000000 1
3     0.04545 0.002065702 1
4     0.00000 0.000000000 1  
1     0.13636 0.018594050 2
2     0.00000 0.000000000 2
3     0.00000 0.000000000 2
4     0.04545 0.002065702 2
5     0.31818 0.101238512 2
6     0.00000 0.000000000 2
7     0.50000 0.250000000 2 
1     0.13636 0.018594050 3 
2     0.09091 0.008264628 3
3     0.40909 0.167354628 3
4     0.04545 0.002065702 3", header=T, stringsAsFactors=F)
mytb$group<-NULL

positionsof1s<-grep(1,mytb$h_no)

mytb$newgroup<-unlist(mapply(function(x,y) 
  rep(x,y),                      # repeat x number y times
  x= 1:length(positionsof1s),    # x is 1 to number of nth group = g1:g3
  y= c( diff(positionsof1s),     # y is number of repeats of groups g1 to penultimate (g2) = 4, 7
        nrow(mytb)-              # this line and the following gives number of repeat for last group (g3)
          (positionsof1s[length(positionsof1s )]-1 )  # number of rows - position of penultimate group (g2) 
      ) ) )
mytb
0赞 Gregor Thomas 3/28/2021 #8

对于这样的事情,该功能非常方便。我们减去序列以将连续序列转换为常量,然后用于创建组 ID:data.tablerleid1:nrow(data)rleid

data$g = data.table::rleid(data$h_no - 1:nrow(data))
1赞 Maël 5/5/2023 #9

一个不错的选择是 ,它从连续数字序列创建唯一 ID。该功能经过高度优化和灵活:collapse::seqid

collapse::seqid(df$h_no)
#[1] 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 3

collapse::seqid(c(1:5, 7:10))
#[1] 1 1 1 1 1 2 2 2 2

collapse::seqid(c(1:5, 7:10), del = 2) #With a delimitation of 2
#[1] 1 2 3 4 5 5 6 7 8

collapse::seqid(c(1, NA, 2), na.skip = TRUE)
#[1]  1 NA  1