将表格从每一行拆分为新表格

Split table into new table from each single row

提问人:Ahmed Hassan 提问时间:9/22/2022 更新时间:9/22/2022 访问量:41

问:

我有一个如下所示的输出文件

head -10 names.txt

AAACCCAAGTGATAAC-1  AAACCCAAGTGATAAC-1
AAACCCACACATTCTT-1  AAACCCACACATTCTT-1
AAACCCACAGTGGCTC-1  AAACCCACAGTGGCTC-1
AAACCCAGTCCCGCAA-1  AAACCCAGTCCCGCAA-1
AAACCCAGTGACTCTA-1  AAACCCAGTGACTCTA-1
AAACCCAGTGGGATTG-1  AAACCCAGTGGGATTG-1
AAACCCAGTTCCAAAC-1  AAACCCAGTTCCAAAC-1
AAACCCATCCATTCGC-1  AAACCCATCCATTCGC-1
AAACCCATCTGTAAGC-1  AAACCCATCTGTAAGC-1
AAACGAAAGAGTCAGC-1  AAACGAAAGAGTCAGC-1

我想拆分它,以便每一行我都得到一个如下所示的文本文件

head AAACCCAAGTGATAAC-1.txt
AAACCCAAGTGATAAC-1  AAACCCAAGTGATAAC-1

然后,我想在循环中运行一个命令,每次都使用其中一个文件。我该怎么做?

sinto filterbarcodes -b possorted_genome_bam.bam -c i.txt -p 8

最好的做法是什么?

Linux DataFrame 终端

评论

0赞 LHLaurini 9/22/2022
这就是我们的目的split
0赞 Ahmed Hassan 9/22/2022
非常感谢,拆分后是否可以将文件扩展名保留为 txt?
0赞 LHLaurini 9/23/2022
是的。用。--additional-suffix=.txt

答: 暂无答案