提问人:alxn 提问时间:1/15/2023 最后编辑:mkrieger1alxn 更新时间:1/15/2023 访问量:48
如何在 Python 中处理迭代
How to deal with iteracy in Python
问:
我有这个代码:
def PCP(seq, feature):
l = []
mean = st.mean(list(feature.values()))
std = np.std(list(feature.values()))
for elem in seq:
for aa in elem:
if aa in feature:
l.append((feature[aa]-mean)/std)
else:
l.append(0)
return l
seq
是带有序列的字符串列表,是以氨基酸为键,以某些值为值的字典。我希望该函数通过列表()中字符串中的每个字符串,并获取字典中对应的值并进行计算。feature
aa
seq
这是我作为 和 dict 输入的一段数据:seq
feature
['KISKDLSIAVQMMKRIHSLLERYPEIL', 'SGRVEKSPHEQEIKFFAKILLPLINQY', 'IDQLIVFGEQLIQKSEPLDAVLIEDEL', ..], pI= {"K":9.47, "P":6.3, "R":10.76, "T":5.6, "A":6.11, "C":5.02, "D":2.98, "E":3.08, "F":5.91, "G":6.06, "H":7.64......}
也许他们有什么问题。
当我运行该函数时,我收到以下错误:
Traceback (most recent call last)
<ipython-input-13-89a7be7ecda7> in <module>
----> 1 test_hydrofobowosc= PCP(test_data_neg, hydrofobowosc)
<ipython-input-12-2f318f9cb908> in PCP(seq, feature)
14 mean = st.mean(list(feature.values()))
15 std = np.std(list(feature.values()))
---> 16 for elem in seq:
17 for aa in elem:
18 if aa in feature:
TypeError: 'NoneType' object is not iterable
怎么了?
答:
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undefined symbol
1/15/2023
#1
“range”返回一个数字列表。
因此,“elem”是一个数字。
因此,它不是可迭代的。
你的意思是“for elem in seq”吗?
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cards
1/15/2023
不要使用答案来写评论
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alxn
1/15/2023
这是我的第一个想法,然后我看到有人改变了它的范围。无论如何,如果我把“for elem in seq”仍然得到“nonetype object”是不可迭代的
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undefined symbol
1/15/2023
这是他为什么会遇到“迭代”问题的答案——他试图迭代一个数字。
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temur
1/15/2023
#2
下面是应该可以工作的代码的修改版本:
def PCP(seq, feature):
l = []
mean = st.mean(list(feature.values()))
std = np.std(list(feature.values()))
for elem in seq:
for aa in elem:
if aa in feature:
l.append((feature[aa]-mean)/std)
else:
l.append(0)
return l
我所做的主要更改是:
- 我没有使用“range(len(seq))”来遍历序列列表,而是直接使用“seq”。这样,“elem”将是列表中的实际字符串,而不是字符串的索引。
- 在嵌套循环中,我使用“aa”作为变量来遍历字符串中的字符。
- 在检查当前字符是否在特征字典中时,我使用了 in 关键字而不是“keys[s]”。这是因为 “keys()” 是一个返回字典键的类似列表对象的方法,您需要使用 “[]” 来访问列表中的项。由于“aa”是一个字符串而不是索引,你可以直接检查它是否在字典中。
- 我将“return l”语句移到了嵌套循环之外,这样它只在完成所有计算后发生一次。
通过这些更改,代码应按预期工作,并将计算值追加到特征字典中具有相应值的序列中每个氨基酸的 l 列表中。
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alxn
1/15/2023
我运行您的代码,但仍然得到“NoneType”对象对于 seq 中 elem 的 -> 不可迭代。你能看看我作为 seq 输入的数据片段吗,我的特征 dict: ['KISKDLSIAVQMMKRIHSLLERYPEIL', 'SGRVEKSPHEQEIKFFAKILLPLINQY', 'IDQLIVFGEQLIQKSEPLDAVLIEDEL', ..] pI= {“K”:9.47, “P”:6.3, “R”:10.76, “T”:5.6, “A”:6.11, “C”:5.02, “D”:2.98, “E”:3.08, “F”:5.91, “G”:6.06, “H”:7.64......} 也许他们错了
评论
return
seq
None
PCP
test_data_neg
None
PCP
seq