提问人:BScpj 提问时间:11/29/2022 最后编辑:Andrej KeselyBScpj 更新时间:11/29/2022 访问量:39
如何打印包含部分输入的所有行?
How to print all rows containing a part of input?
问:
我有一个包含序列和基因名称的 csv 文件。我想从用户那里获取输入,并将包含用户输入的所有行打印为一部分。举个例子,我的数据是;
Gene 1 ATGCGGTCTA
Gene 2 ACGCCCATGA
Gene 3 TCGAC
当用户输入 GC 时,结果必须是
Gene 1 ATGCGGTCTA
Gene 2 ACGCCCATGA
因为两者的序列中都有 GC。
到目前为止,我尝试了;
import csv
import sys
import pandas as pd
csv_file = csv.reader(open('DATA.csv', "r"), delimiter=",")
z=input('what would you like to search?').lower()
if z=='sequence':
s=input('Enter sequence : ').upper()
df = pd.read_csv('DATA.csv')
a = list(df['seq'])
b = ' '.join(str(s) for s in a)
c= b.find(s)
答:
0赞
Anton B
11/29/2022
#1
使用并假设带有序列的 DataFrame 列被调用,您可以执行以下操作:pandas
sequences
filtered_df = df[df['sequences'].str.contains(s)]
上一个:两个相关序列
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csv_file