提问人:zzzbbx 提问时间:6/16/2012 更新时间:8/1/2021 访问量:129461
在 Python 中解析制表符分隔的文件
parsing a tab-separated file in Python
问:
我正在尝试解析 Python 中的制表符分隔文件,其中将 k 个制表符放在行开头之外的数字应该放入第 k 个数组中。
除了逐行读取并执行朴素的解决方案将执行的所有明显处理之外,是否有内置函数或更好的方法可以做到这一点?
答:
7赞
dawg
6/16/2012
#1
喜欢这个:
>>> s='1\t2\t3\t4\t5'
>>> [x for x in s.split('\t')]
['1', '2', '3', '4', '5']
对于文件:
# create test file:
>>> with open('tabs.txt','w') as o:
... s='\n'.join(['\t'.join(map(str,range(i,i+10))) for i in [0,10,20,30]])
... print >>o, s
#read that file:
>>> with open('tabs.txt','r') as f:
... LoL=[x.strip().split('\t') for x in f]
...
>>> LoL
[['0', '1', '2', '3', '4', '5', '6', '7', '8', '9'],
['10', '11', '12', '13', '14', '15', '16', '17', '18', '19'],
['20', '21', '22', '23', '24', '25', '26', '27', '28', '29'],
['30', '31', '32', '33', '34', '35', '36', '37', '38', '39']]
>>> LoL[2][3]
23
如果要转置输入:
>>> with open('tabs.txt','r') as f:
... LoT=zip(*(line.strip().split('\t') for line in f))
...
>>> LoT[2][3]
'32'
或者(更好的是)在默认发行版中使用 csv 模块......
71赞
Gareth Latty
6/16/2012
#2
您可以使用 csv
模块轻松解析制表符分隔的值文件。
import csv
with open("tab-separated-values") as tsv:
for line in csv.reader(tsv, dialect="excel-tab"): #You can also use delimiter="\t" rather than giving a dialect.
...
其中 是每次迭代的当前行上的值列表。line
编辑:如下所述,如果您想按列而不是按行阅读,那么最好的办法是使用内置的:zip()
with open("tab-separated-values") as tsv:
for column in zip(*[line for line in csv.reader(tsv, dialect="excel-tab")]):
...
15赞
martineau
6/16/2012
#3
我不认为目前的任何答案都真正做到了你所说的你想要的。(更正:我现在看到 @Gareth Latty / @Lattyware 已将我的答案作为接近结尾的“编辑”合并到他自己的答案中。
无论如何,这是我的看法:
假设这些是输入文件中的制表符分隔值:
1 2 3 4 5
6 7 8 9 10
11 12 13 14 15
16 17 18 19 20
那么这个:
with open("tab-separated-values.txt") as inp:
print( list(zip(*(line.strip().split('\t') for line in inp))) )
将产生以下内容:
[('1', '6', '11', '16'),
('2', '7', '12', '17'),
('3', '8', '13', '18'),
('4', '9', '14', '19'),
('5', '10', '15', '20')]
如您所见,它将每行的第 k 个元素放入第 k 个数组中。
1赞
Alauddin Sabari
8/1/2021
#4
你可以通过python pandas pd.read_csv('file_name.tsv', sep='\t')
[注意:需要使用此命令 pip install pandas 安装 pandas]
评论