vcf-variant-call-format 问答列表

Samtools mpileup:从输入文件读取时出错

作者:Juliette G. 提问时间:7/14/2023

我正在编写一个代码来使用 R 分析酵母测序数据。我能够使用 BWA 进行对齐,从而使用 samtools 获得 .bam 文件及其 .bai 索引。我的下一步是使用 bcftools 执行变体调用。这...

MAFTOOLS:将扩增子测序数据中的变体添加到WES数据生成的MAF文件中

作者:AnandamidaCBD 提问时间:7/18/2023

我对生物信息学比较陌生,我需要一些帮助,将使用扩增子数据测序的特定基因的变异(由于热点测序不良)添加到 MAF(突变注释格式)文件中。目的是正确地对这一代进行肿瘤。我拥有的 MAF 文件完全由 WES...


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