Bash 问答列表

如何过滤一个 fastq 文件,发现一个退化模式?[已结束]

作者:Marco 提问时间:7/9/2023

已关闭。这个问题需要更加集中。它目前不接受答案。 想改进这个问题吗?通过编辑这篇文章来更新问题,使其仅关注一个问题。 5个月前关闭。 改进此问题 我想过滤一个 fastq 文件,以便仅输出呈现...

为什么在单个 shell 脚本中运行多个针对 ENA 的 wget 命令时 wget 会失败?[已结束]

作者:Sj1993 提问时间:8/15/2023

闭。这个问题与编程或软件开发无关。它目前不接受答案。 这个问题似乎不是关于特定的编程问题、软件算法或程序员主要使用的软件工具。如果您认为该问题在另一个 Stack Exchange 站点上是主题,您...

对于每个文件的循环 Illumina fastq + mkdir

作者:nermze 提问时间:10/30/2023

我有大约 1000 个 WGS fastq 配对端读,我想通过 mydbfinder 在本地处理,因为使用在线版本每个样本都需要很长时间。 我在处理Illumina配对端读取方面没有太多经验,但我能...

在 bash 脚本中运行 docker 命令会导致分段错误

作者:silencej 提问时间:3/1/2017

这些命令如下: docker run / stop / rm ... 这在终端中起作用,同时导致 bash 脚本中的分段错误。 我比较了 bash 脚本和终端之间的环境,如下所示。 2c2 ...

AWS CLI:对于 Amazon ses:调用 SendRawEmail 操作时出错 (InvalidParameterValue):缺少所需的标头“To”

作者:darrin 提问时间:11/16/2023

由于我一直在与 Chat GPT 就此问题搏斗了一段时间,我认为其他人将来会遇到这个问题。这是瘦的: 我编写了一个脚本,我想从内部构建过程发送电子邮件。它在我的 mac 上运行良好,但我们在 ci ...

在 Bash 中使用 shell 脚本从文件解析版本号

作者:TorusWithSprinkles 提问时间:8/11/2023

我正在尝试从目录如下所示的文件中提取版本号: ... /directory/to/java/bin/./java -version 从命令行运行它会产生以下输出: java version "...

在执行操作时将值分配给变量?[复制]

作者:Viswa 提问时间:10/6/2018

这个问题在这里已经有答案了: 如何在 Bash 中将变量设置为命令的输出? (16 个回答) 5年前关闭。 谁能告诉我我应该如何在 Bash 中将数字的平方根值分配给变量? 这是我的代码。 #!...

有没有办法在 Linux 上为 Java Dev Eclipse(特别是 C++ 插件)编写附加组件?

作者:21kondav 提问时间:1/18/2023

我正在尝试为学术界的计算机科学 linux 实验室编写部署脚本。此部署的一部分是 Eclipse for Java Development IDE。教授们也希望C++插件,IT管理部门希望它是自动化的...

过滤床文件中的重叠条目

作者:maciek 提问时间:4/16/2017

我有一个床文件,如下所示: 1 183113 183114 chr1:183113-183240 0 + 1 187286 187287 chr1:187128-187287 0 - 1 18757...

重命名多个子目录,以父目录的名称为前缀

作者:Nayab Qureshi 提问时间:6/30/2023

我有多个目录 1111、2222、3333、4444,每个目录内都有名为 _apple 的子目录。我想将父文件夹名称作为前缀添加到子目录中。 我所拥有的是 1111 _apple 2222 ...


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