这是一个类似的问题： Snakemake：使用 python 嵌套列表推导进行条件分析 我有以下几点： RUN_ID = ["run1", "run2"] SAMPLES = [["A", "B...

我正在尝试创建 snakemake 规则，该规则接受输入我的 fastq 文件并在输出中为每个文件返回一个 .sam 文件。fastq 我有一个这样的文件： FILE TYPE SM LB ID ...

我正在使用 snakemake 版本 7.30.1 我正在尝试使用 snakemake --cores 4 运行我的 snakemake 工作流程。Snakemake 似乎能够找到输入文件，并且似乎...

我正在创建一个 snakemake 工作流程。直到昨天，我从未使用过 run 或 script 指令。我有一个运行指令，效果很好，但抱怨它太长了，并说我应该创建一个单独的脚本并使用脚本指令：snake...

我正在尝试使用配置文件config.yaml制作Snakemake管道。 --- samples: - Sample_1: reads/raw_reads_1 - Sample_2: reads/...