有向图/树的树状图

Dendrogram to a directed graph/tree

提问人:gennifer montaño rodriguez 提问时间:10/27/2023 更新时间:10/27/2023 访问量:24

问:

我正在尝试将树状图转换为图形/树,以使用其节点、叶子和子树执行计算并找到混合子图,但我还没有找到在此过程中对我有帮助的函数/包

我试图将 dendogram 转换为“newick”格式,但我不确定这是否是更好的方法。

我使用'scipy.cluster.hierarchy' pakege创建了dendogram

有什么想法吗?

Python 数据帧 分层聚类树 状图

评论


答:

0赞 sun_is_bright 10/27/2023 #1

使用 .to_tree 函数,可以将代码中作为 Z 返回的链接矩阵转换为树对象。

tree_Z = hierarchy.to_tree(Z)

这为您提供了一个可以遍历的 ClusterNode Tree 对象。