clustree图像生成的复杂性-解网

问：

运行以下代码（最初没有 par （lwd = 1）行）返回以下错误，在设置 par（lwd = 1）或 0.5 或 10 后再次返回相同的错误。说实话，当我更改该变量而不是更改绘图线条的宽度时，不完全了解发生了什么？

任何见解将不胜感激。我是 R 的新手，并尝试执行一些自己的 scRNA 分析，但想使用 clustree 来可视化和确定数据集中 # 个簇。在这项工作之前，我只会在修拉中搞砸我的决议，并找到一些看似合理的东西——但更喜欢这种方法，并想了解我在未来做错了什么。感谢您的任何帮助！！

#Use clustree to determine best resolution for this dataset 
library(clustree)
CD4_PI_clust <- FindClusters(CD4_g_PI, resolution = c(0, .1, .2, .3, .4, .5, .6, .7, .8, .9, 1))

par(lwd = 1)
det_clus_num <- clustree(x = CD4_PI_c[email protected], prefix = "RNA_snn_res.")
det_clus_num

上面解释！

R 生物信息学分辨率分层聚类 RNA-seq

CD45_tumor_biopsy <- FindClusters（CD45_tumor_biopsy， resolution = c（0， 0.1， 0.2， 0.4， 0.5， 0.6， 0.8， 1.0）） par（lwd = 1） plot_clustree <- clustree（[email protected]， prefix = “RNA_snn_res.”） plot_clustree 遵循您的代码，我相信它与我自己的代码相同？但仍然收到相同的错误。堆栈新手，所以不确定为什么我的代码是在没有逐行符号/格式的情况下编写的，但在我的脚本中，我是逐行编写的。相同的错误> plot_clustree check.length（gparname）中的错误：即使设置 par（lwd = 1），'gpar' 元素 'lwd' 也不得为长度 0

答： 暂无答案

上一个：使用犰狳库在 c++ 中计算 Dunn's Index 时出错

下一个：跨多个变量进行配对聚类，尊重预先存在的分组变量

clustree图像生成的复杂性

Complication with clustree image generation

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