RNA-seq 问答列表

将“DeseqStats”对象转换为 pandas 数据帧?

作者:alexis 提问时间:7/18/2023

是否可以将 DeseqStats 对象从 PyDESeq2 转换为 Pandas DataFrame? results_summary = stat_res results_as_html = re...

在 Ubuntu 上处理 Fastq 文件时发生文件错误失败

作者:Rick Z 提问时间:6/14/2023

当我尝试处理 Fastq 文件时,发生了以下错误。谁能帮我解决这个错误? 错误如图所示 我尝试了这个代码:./run_swift_sarscov2_docker.sh -v sarscov2_v2...

在过滤单细胞RNA测序数据时遇到一些问题

作者:Arka26 提问时间:3/23/2023

目前,我正在尝试过滤一些用于单细胞RNA测序的数据,这个过程需要使用python。我正在尝试运行以下代码,但遇到了一些错误。 %pylab inline import warnings warni...

clustree图像生成的复杂性

作者:ghoeltzel 提问时间:10/15/2023

运行以下代码(最初没有 par (lwd = 1) 行)返回以下错误,在设置 par(lwd = 1) 或 0.5 或 10 后再次返回相同的错误。说实话,当我更改该变量而不是更改绘图线条的宽度时,不...

Seurat 中的 CellCycleScoring 问题说“Rowmeans”下标越界

作者:Dagny 提问时间:11/14/2023

对于 R (4.2.0) 中的单单元数据集,我使用的是我的典型工作流程,我通常不会遇到任何问题。 尝试使用Seurat的CellCycleScoring()时,我不断收到以下错误: Error i...


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