修整 fastq.gz 文件

Trimming fastq.gz files

提问人:Ahmed Hassan 提问时间:11/17/2023 更新时间:11/17/2023 访问量:11

问:

我有多个fastq.gz文件,我只想保留fastq的前8个碱基并删除其余的

input
@HWI-ST1072:187:C35YUACXX:7:1101:1609:1983 1:N:0:ACAGTG
NGGAGAAAGAGAGTGTGTTTTTAGGGGGAGATTTTTAAAATGGTTGTTTTG
+
#0<BFFFFFFFFF<BFFFIIFFFFFIIIBFFFFFIIFIIIIIFFBFFFFFF


output
@HWI-ST1072:187:C35YUACXX:7:1101:1609:1983 1:N:0:ACAGTG
NGGAGAAA
+
#0<BFFFF

我尝试了 Fastx 和 seqk - 没有运气。我该怎么办?

序列 FASTQ

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