我的目标是增加此 fastq 验证的重试次数，该验证有时会因网络问题而失败，尽管有给定 NCBI SRA id 的数据，但它失败了。因此，在中止之前，我需要至少增加重试 5 次。 我该怎么做？ s...

我在 Windows 2 上使用 dada 1.22.0 版本“10”，我有压缩 （.gz） fastq 文件列表，当我使用函数 filterAndTrim 时，我收到以下错误消息： add（bin...

我正在尝试创建 snakemake 规则，该规则接受输入我的 fastq 文件并在输出中为每个文件返回一个 .sam 文件。fastq 我有一个这样的文件： FILE TYPE SM LB ID ...

在哪里可以找到fastq格式的公开的正常人类样本（非疾病）RNA seq数据，最好使用Illumina平台进行测序。我在哪里可以找到这样的fastq文件？...

我想得到一个 fastq 文件，其中包含 fastq 读取，这些读取在 中但不在 .F1.fastqF2.fastq 此处提供了以下代码作为解决方案。 needed_reads = [] read...

我需要帮助用 Python3 解决以下问题： 编写一个读取 fastq 文件的 Python 程序，并计算有多少碱基的 Phred 碱基读取质量为零，介于 1 和 10（含）、11 和 20、21 和...

如果我的文件 （final.contig.fa） 中有 1118 个重叠群序列，我如何确定此文件中所有 1118 个序列的生物学序列？ 我运行了 cat final.contig.fa，它给了我前 ...

当我尝试处理 Fastq 文件时，发生了以下错误。谁能帮我解决这个错误？ 错误如图所示 我尝试了这个代码：./run_swift_sarscov2_docker.sh -v sarscov2_v2...

我将为文件夹中的多个 fastq 文件运行以下代码。在一个文件夹中，我有不同的fastq文件;首先，我必须读取一个文件并通过激活 miniconda 执行所需的操作，然后将结果存储在单独的文件中。fa...

已关闭。这个问题需要更加集中。它目前不接受答案。 想改进这个问题吗？通过编辑这篇文章来更新问题，使其仅关注一个问题。 5个月前关闭。 改进此问题 我想过滤一个 fastq 文件，以便仅输出呈现...