Seurat 中的 CellCycleScoring 问题说“Rowmeans”下标越界

Issue with CellCycleScoring in Seurat Saying 'Rowmeans' subscript is out of bounds

提问人:Dagny 提问时间:11/14/2023 最后编辑:PhilDagny 更新时间:11/14/2023 访问量:43

问:

对于 R (4.2.0) 中的单单元数据集,我使用的是我的典型工作流程,我通常不会遇到任何问题。

尝试使用Seurat的CellCycleScoring()时,我不断收到以下错误:

Error in h(simpleError(msg, call)) :
error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 'rowMeans': subscript out of bounds

我从未遇到过这个错误,解决这个答案的其他问题还没有帮助我弄清楚发生了什么,但我不太确定从哪里开始(我现在只使用 R 几个月了,所以我对这些事情不是很有经验),并希望得到更熟悉的人的帮助!

我尝试在 Seurat 中使用 CellCycleScoring 函数,但收到错误。

R 细胞 修拉 RNA-seq

评论

1赞 Dagny 11/14/2023
更新:缩放我的数据后,问题以某种方式解决了!有点奇怪,但如果其他人有这个问题,也许可以先尝试规范化和扩展它:)

答: 暂无答案