提问人：Jacob_K 提问时间：9/3/2023 最后编辑：marc_sJacob_K 更新时间：9/3/2023 访问量：31
确定通过特定基因的表达分离 Seurat 对象的良好阈值
Determining a good threshold to separate Seurat Object by a specific gene's expression
问：
我正在尝试将我的 Seurat 对象中的细胞注释为特定基因的阳性或阴性。我想知道是否有任何特殊的方法可以确定一个细胞在表达特定基因时是阳性还是阴性的良好阈值？
这是从 Github 注释 Lyz 阳性细胞的示例代码。
lyz.pos <- WhichCells(object = pbmc_small, expression = LYZ > 1)
我也想知道表达水平> 1 是什么意思？它是对数转换的还是原始的 mRNA 计数？鉴于此，我们应该如何为细胞对特定基因的阳性或阴性设置一个良好的阈值？
答： 暂无答案
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