在geom_boxplot中将标准误差添加为阴影区域而不是误差线-解网

问：

我有我的，我在箱形图上添加了一条线的平均值。我想添加标准错误，但我不想要错误栏。boxplotstat_summary

基本上，我想将标准错误添加为阴影区域，因为您可以使用 .geom_ribbon

我使用数据集简要地向您展示了我尝试过的内容。PlantGrowth

library(ggplot2) 

ggplot(PlantGrowth, aes(group, weight))+ 
stat_boxplot( geom='errorbar', linetype=1, width=0.5)+ 
geom_boxplot(fill="yellow4",colour="black",outlier.shape=NA) + 
stat_summary(fun.y=mean, colour="black", geom="line", shape=18, size=1,aes(group=1))+ 
stat_summary(fun.data = mean_se, geom = "errorbar")

我使用 in 做了它，并尝试用替换，正如我在网络上的其他一些例子中看到的那样，但它不起作用。geom_errorbarstat_summarygeom_errorbargeom_ribbon

像这样的东西，但错误是阴影区域而不是误差线（这让它看起来有点混乱）

r ggplot2 箱线图误差栏

将如此多的几何图形分层变得难以阅读，但这里有一个带有一些选项的简化版本。除了稍微精简一下以查看我正在编辑的内容外，我还添加了一个磁贴作为摘要几何图形;Tile 类似于 rect，只是它假定它将在其 x 值居中，因此您无需担心所需的 x 轴位置。您可以尝试填充颜色和不透明度 - 我将箱线图设置为白色只是为了更好地说明。geom_rect

library(ggplot2) 

gg <- ggplot(PlantGrowth, aes(x = group, y = weight)) +
  stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.5) +
  geom_boxplot(fill = "white", outlier.shape = NA, width = 0.7) +
  stat_summary(aes(group = 1), fun.y = mean, geom = "line")

gg +
  stat_summary(fun.data = mean_se, geom = "tile", width = 0.7,
               fill = "pink", alpha = 0.6)

根据您对需要功能区的注释，您可以改用与线条相同的功能区。group = 1

gg +
  stat_summary(aes(group = 1), fun.data = mean_se, geom = "ribbon", 
               fill = "pink", alpha = 0.6)

功能区在离散变量中没有多大意义，但这里有一个示例，其中包含一些连续组的虚拟数据，其中这种设置变得更加合理（尽管 IMO 仍然难以阅读）。

pg2 <- PlantGrowth
set.seed(123)
pg2$cont_group <- floor(runif(nrow(pg2), 1, 6))

ggplot(pg2, aes(x = cont_group, y = weight, group = cont_group)) +
  stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.5) +
  geom_boxplot(fill = "white", outlier.shape = NA, width = 0.7) +
  stat_summary(aes(group = 1), fun.y = mean, geom = "line") +
  stat_summary(aes(group = 1), fun.data = mean_se, geom = "ribbon", 
               fill = "pink", alpha = 0.6)

特别的是，我之前没有计算平均值和 se，而且我的数据框中没有这些数据。为了更快（我想）并且不那么费力地编写代码。所以我不能使用 geom_line 和 geom_ribbon，我尝试使用 stat_summary 函数来计算这些统计数据以绘制它们。该函数可以很好地计算这些统计信息，但仅将误差添加为误差线，而不是阴影区域。也许我错了，但我不知道怎么做。我希望我更清楚。

0赞 camille 9/28/2019

@AntonioManco这样的色带没有多大意义，因为 x 轴是离散的，而不是连续的，所以它可能会产生误导

1赞 Antonio Manco 9/28/2019

我使用 PlantGrowth 数据集只是为了提供一个简单的日期集来重现我的地块，因为我的数据集更大，共享起来更复杂。我有一个连续的 x 轴，一天中的小时数。

0赞 Antonio Manco 10/2/2019

哎呀。现在就像我想要它用于我的连续 x 轴的情节一样！谢谢@camille！

上一个：如何使用ggplot将两个具有不同比例的y轴放在绘图的同一侧？

下一个：如何将 Y 轴上的绘图与绘图网格对齐 0？

在geom_boxplot中将标准误差添加为阴影区域而不是误差线

Add standard error as shaded area instead of errorbars in geom_boxplot

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