提问人:letsrock 提问时间:3/8/2011 最后编辑:Henrikletsrock 更新时间:3/26/2021 访问量:5859
为连续序列和拆分向量创建分组变量
Create grouping variable for consecutive sequences and split vector
问:
我有一个向量,例如,我想将形成一个规则的、连续序列的“相邻”元素组合在一起,即增加 1,在一个参差不齐的向量中,结果是:c(1, 3, 4, 5, 9, 10, 17, 29, 30)
L1:1 L2:3,4,5 L3:9,10 L4:17
L5:29,30
朴素代码(前 C 程序员):
partition.neighbors <- function(v)
{
result <<- list() #jagged array
currentList <<- v[1] #current series
for(i in 2:length(v))
{
if(v[i] - v [i-1] == 1)
{
currentList <<- c(currentList, v[i])
}
else
{
result <<- c(result, list(currentList))
currentList <<- v[i] #next series
}
}
return(result)
}
现在我明白了
a) R 不是 C(尽管有大括号) b) 全局变量是纯粹的邪恶
c)
这是一种实现结果的非常低效的方法
,因此欢迎任何更好的解决方案。
答:
您可以轻松定义切割点:
which(diff(v) != 1)
基于该尝试:
v <- c(1,3,4,5,9,10,17,29,30)
cutpoints <- c(0, which(diff(v) != 1), length(v))
ragged.vector <- vector("list", length(cutpoints)-1)
for (i in 2:length(cutpoints)) ragged.vector[[i-1]] <- v[(cutpoints[i-1]+1):cutpoints[i]]
其结果是:
> ragged.vector
[[1]]
[1] 1
[[2]]
[1] 3 4 5
[[3]]
[1] 9 10
[[4]]
[1] 17
[[5]]
[1] 29 30
这个算法不是一个好算法,但你可以根据:)编写更整洁的代码祝你好运!diff
Daroczig 写道:“你可以根据”......diff
这是一种方法:
split(v, cumsum(diff(c(-Inf, v)) != 1))
编辑(添加时间):
Tommy 发现,通过谨慎使用类型,这可以更快;它变得更快的原因是它在整数上更快,实际上在因子上更快。split
这是约书亚的解决方案;的结果是一个数字,因为它是 'd 和 ,所以它是最慢的。cumsum
c
1
system.time({
a <- cumsum(c(1, diff(v) != 1))
split(v, a)
})
# user system elapsed
# 1.839 0.004 1.848
只是这样,结果是一个整数,大大加快了它的速度。c
1L
system.time({
a <- cumsum(c(1L, diff(v) != 1))
split(v, a)
})
# user system elapsed
# 0.744 0.000 0.746
这是 Tommy 的解决方案,供参考;它也在整数上分裂。
> system.time({
a <- cumsum(c(TRUE, diff(v) != 1L))
split(v, a)
})
# user system elapsed
# 0.742 0.000 0.746
这是我的原始解决方案;它还在整数上进行拆分。
system.time({
a <- cumsum(diff(c(-Inf, v)) != 1)
split(v, a)
})
# user system elapsed
# 0.750 0.000 0.754
这是 Joshua 的,结果转换为 .split
system.time({
a <- cumsum(c(1, diff(v) != 1))
a <- as.integer(a)
split(v, a)
})
# user system elapsed
# 0.736 0.002 0.740
整数向量上的所有版本都大致相同;如果该整数向量已经是一个因子,它可能会更快,因为从整数到因子的转换实际上需要大约一半的时间。在这里,我直接把它变成一个因素;通常不建议这样做,因为它取决于因子类的结构。此处仅用于比较目的。split
system.time({
a <- cumsum(c(1L, diff(v) != 1))
a <- structure(a, class = "factor", levels = 1L:a[length(a)])
split(v,a)
})
# user system elapsed
# 0.356 0.000 0.357
评论
split
as.integer
as.integer(0.3*3+0.1)
0
大量使用一些 R 习语:
> split(v, cumsum(c(1, diff(v) != 1)))
$`1`
[1] 1
$`2`
[1] 3 4 5
$`3`
[1] 9 10
$`4`
[1] 17
$`5`
[1] 29 30
您可以使用 和 创建元素并将其分配给组,然后使用以下命令进行聚合:data.frame
diff
ifelse
cumsum
tapply
v.df <- data.frame(v = v)
v.df$group <- cumsum(ifelse(c(1, diff(v) - 1), 1, 0))
tapply(v.df$v, v.df$group, function(x) x)
$`1`
[1] 1
$`2`
[1] 3 4 5
$`3`
[1] 9 10
$`4`
[1] 17
$`5`
[1] 29 30
约书亚和亚伦很到位。但是,通过谨慎使用正确的类型、整数和逻辑,它们的代码仍然可以提高两倍以上的速度:
split(v, cumsum(c(TRUE, diff(v) != 1L)))
v <- rep(c(1:5, 19), len = 1e6) # Huge vector...
system.time( split(v, cumsum(c(1, diff(v) != 1))) ) # Joshua's code
# user system elapsed
# 2.64 0.00 2.64
system.time( split(v, cumsum(c(TRUE, diff(v) != 1L))) ) # Modified code
# user system elapsed
# 1.09 0.00 1.12
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