如何确定最终重叠群中序列的来源

how do I determine the source of a sequence in my final contigs

提问人:Ehicares 提问时间:4/10/2023 更新时间:4/10/2023 访问量:12

问:

如果我的文件 (final.contig.fa) 中有 1118 个重叠群序列,我如何确定此文件中所有 1118 个序列的生物学序列?

我运行了 cat final.contig.fa,它给了我前 40 个序列,所以我在这些序列上运行了 BLAST。但我总共有 1118 个序列的重叠群。

序列 FASTQ

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