信息学 问答列表

如何将标题添加到以第二列作为目录名称的列 [duplicate]

作者:Shafaque Zahra 提问时间:10/18/2023

这个问题在这里已经有答案了: Bash 中单引号和双引号的区别 (7 个答案) 上个月关闭。 我在多个目录中都有包含 ID 和计数的计数文件(对于每个登录 SRRXXXXX)。我想使用 bash 循...

clustree图像生成的复杂性

作者:ghoeltzel 提问时间:10/15/2023

运行以下代码(最初没有 par (lwd = 1) 行)返回以下错误,在设置 par(lwd = 1) 或 0.5 或 10 后再次返回相同的错误。说实话,当我更改该变量而不是更改绘图线条的宽度时,不...

分析多个分类性状和一个连续性状

作者:Batro 提问时间:10/14/2023

我的数据集包含多个名义非二元变量(即喙形状类型、一般眼睛位置),这些变量被表示/编码为数字。例如,对于“喙形状类型”,有 4 个选项,1-4,每个选项代表不同的形状。这些变量不是有序的。我还有一个连续...

如何获取TCGA中TP53(特别是密码子72)多态性的数据

作者:D Schönegger 提问时间:10/11/2023

我想知道是否有可能获得 TP53 密码子 72 对 TCGA 中不同癌症的多态性数据。 使用TCGAbiolinks,我可以检索“简单核苷酸变异”数据,例如使用: data.category = ...

如何在没有__hash__的情况下删除对象列表中的重复项

作者:BioGeek 提问时间:10/10/2017

我有一个自定义对象列表,我想从中删除重复项。通常,您可以通过定义对象 和 然后获取对象列表来执行此操作。我已经定义了,但我无法想出一种很好的实现方法,以便它为相等的对象返回相同的值。__eq____h...

发现氨基酸序列中的突变(错义、移码)

作者:Manuela Ceccarelli 提问时间:8/6/2023

我有一个列表,列出了同一蛋白质不同长度的近 4k 个氨基酸序列,我想找到任何错义或移码的差异(突变)。 需要明确的是,我从这个开始: seqs <- c("FLGKIWPSYKGRPGNF", "...

在多分辨率文件上迭代运行软件

作者:Anon 提问时间:7/22/2023

.mcool 文件包含多个分辨率的矩阵。 一个 .mcool 文件的冷却器: cooler ls ./../input/A001C007.hg38.nodups.pairs.mcool ./.....

从另一个文件中的文件中搜索文本模式

作者:Noha Kamal 提问时间:7/17/2023

我有两个文本文件。“file1.txt”包含大量字符串,每个字符串有 77 个字符。每个字符串都在自己的行中,每组行都由一个新行分隔。每行看起来都类似于下面的示例。块由不同数量的行组成,如下所示: ...

“同时读 -r 行;do“无法识别计数器变量

作者:pooch 提问时间:6/14/2023

我有可用于处理每一行文件的代码,但是当我尝试在 while 循环中使用计数器变量将迭代限制为整数“n”时,它不再有效。 这是我的代码: # Output file for biallelic S...

如何使用 RDKIT 从 mol 文件中获取所有 n 个原子片段(子结构)?

作者:meadeytabeedy 提问时间:4/19/2023

我有兴趣获得在较大分子中包含 4 个非氢原子的片段或子结构。 最接近实现此目的的示例来自 https://iwatobipen.wordpress.com/2020/08/12/get-and-dr...


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