我目前正在处理一个文件（一个文本文件），其中包含 DNA 提取序列（重叠群）列表，每个序列都有一个标题，后跟核苷酸行，这是该重叠群的核苷酸长度。有 120 个重叠群，每个条目都用以“>”开头的行标记，...

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我编写了一个函数来计算质心与其多边形边缘之间的最大距离，但我无法弄清楚如何在简单要素 （“sf） data.frame 的每个单独面上运行它。 library(sf) distance.func ...

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这是一个生物信息学问题。 对于那些熟悉 ggtree 的人，我该如何在 ggtree 中注释每个节点和提示的数字信息？ 例如，假设我有一个系统发育树，对于每个节点和尖端，我都有一个基因计数。如何在...

你好，我有一个问题。 我有两个这样的列表： list1 = ['G','C','A','T','C','A'] list2 = ['G','A','*','T','AC','A'] 我想在 p...

我在 Windows 2 上使用 dada 1.22.0 版本“10”，我有压缩 （.gz） fastq 文件列表，当我使用函数 filterAndTrim 时，我收到以下错误消息： add（bin...

是否可以将 DeseqStats 对象从 PyDESeq2 转换为 Pandas DataFrame？ results_summary = stat_res results_as_html = re...

我想得到一个 fastq 文件，其中包含 fastq 读取，这些读取在 中但不在 .F1.fastqF2.fastq 此处提供了以下代码作为解决方案。 needed_reads = [] read...

我正在尝试为交易 ID 是连续的时创建一个标志。由于我不会在这里讨论的原因，这些可能是一个危险信号。我遇到的问题是 ID 没有标准化。有些只能是数字，有些是字母数字。我想确定供应商的交易是连续的 X ...