聚类 问答列表

如何对混淆矩阵的 cutree 结果重新排序?

作者:Christiano dos Santos 提问时间:10/24/2023

我正在使用 300 个样本的红外光谱数据进行 HCA,因此我的数据帧为 300x3606。变量范围为:new_hca_data <- new_hca_data_all[,6:3606] hc.new...

NbClust - 如何在 R 中仅从 NbClust 中删除一个索引?

作者:last_resource 提问时间:10/25/2023

我正在使用该函数根据多数规则定义最佳簇数,并确定最佳分区。我正在使用一个不平衡的面板,我正在逐年应用该功能。 几年来(我几乎无法识别它们,因为它们并不总是相同的,我不知道为什么)该函数返回以下错误Nb...

有向图/树的树状图

作者:gennifer montaño rodriguez 提问时间:10/27/2023

我正在尝试将树状图转换为图形/树,以使用其节点、叶子和子树执行计算并找到混合子图,但我还没有找到在此过程中对我有帮助的函数/包 我试图将 dendogram 转换为“newick”格式,但我不确定这...

R 中可变长度轨迹的聚类

作者:rb446611 提问时间:10/28/2023

我有一个数据集,其中包含多个可变长度的空间路径轨迹(即 X 和 Y 坐标的时间序列)。我希望根据它们形状的相似性对它们进行分组(例如,圆形的轨迹将组合在一起,三角形的轨迹将组合在一起),并倾向于使用分...

使用 R 的 DBSCAN 聚类中的马氏距离

作者:Anna 提问时间:10/31/2023

我已经阅读了 R 文档和一些来源。据我了解,R 中的 DBSCAN 语法会自动使用欧几里得距离。例如,如以下语法所示: kNNdist(data, k = 3) kNNdistplot(data,...

无法仅使用 sns.heatmap 复制聚类图图

作者:athantas 提问时间:11/1/2023

给定一个链接矩阵,我从中得到的热图与我使用的热图不同。Zg = sns.clustermap(corr)sns.heatmap(corr[np.ix_(g.dendrogram_row.reorder...

从 dendextend 包中color_branches检索重叠的子树状图

作者:Romina Appierdo 提问时间:11/4/2023

我正在尝试使用 dendextend 包中的 color_branches 函数为使用 complexheatmap 创建的热图的树状图分支着色。 我遇到了一个奇怪的行为,正如你在图片中看到的那样:...


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