分层聚类 问答列表

为什么树状图结构与我在 3D PCoA 中看到的数据不同?

作者:vanguard605 提问时间:10/28/2023

此问题是从 Stack Overflow 迁移而来的,因为它可以在交叉验证中回答。16 天前迁移。 我对从一系列物种分布模型文本计算出的相异矩阵进行了分层聚类,我似乎在数据的树状图和 3D PCoA...

R 文本聚类(单词属于哪个聚类)

作者:Vincent ISOZ 提问时间:8/15/2023

我从这里获取了以下文本聚类代码脚本: https://medium.com/@SAPCAI/text-clustering-with-r-an-introduction-for-data-scien...

clustree图像生成的复杂性

作者:ghoeltzel 提问时间:10/15/2023

运行以下代码(最初没有 par (lwd = 1) 行)返回以下错误,在设置 par(lwd = 1) 或 0.5 或 10 后再次返回相同的错误。说实话,当我更改该变量而不是更改绘图线条的宽度时,不...

跨多个变量进行配对聚类,尊重预先存在的分组变量

作者:GiulioGCantone 提问时间:10/15/2023

我有一个包含列、一个分组变量和 300 个数值变量的琐碎物品。idG 我想要一种方法,将原始数据聚类到聚类中的每一行与每个分组变量中的另一行匹配/配对。 这应该是 1kNN。奇数组中的备用原始数据可...

使用犰狳库在 c++ 中计算 Dunn's Index 时出错

作者:Duplic8e 提问时间:10/23/2023

我一直在尝试使用犰狳库为我正在研究的更大算法找到 Dunns 索引。每当我运行代码时,我都会收到一个输出和一个错误,说我超出了索引。我提供了下面的代码和我用来测试的主要函数。该代码还包含我添加的随机检...

如何对混淆矩阵的 cutree 结果重新排序?

作者:Christiano dos Santos 提问时间:10/24/2023

我正在使用 300 个样本的红外光谱数据进行 HCA,因此我的数据帧为 300x3606。变量范围为:new_hca_data <- new_hca_data_all[,6:3606] hc.new...

NbClust - 如何在 R 中仅从 NbClust 中删除一个索引?

作者:last_resource 提问时间:10/25/2023

我正在使用该函数根据多数规则定义最佳簇数,并确定最佳分区。我正在使用一个不平衡的面板,我正在逐年应用该功能。 几年来(我几乎无法识别它们,因为它们并不总是相同的,我不知道为什么)该函数返回以下错误Nb...

有向图/树的树状图

作者:gennifer montaño rodriguez 提问时间:10/27/2023

我正在尝试将树状图转换为图形/树,以使用其节点、叶子和子树执行计算并找到混合子图,但我还没有找到在此过程中对我有帮助的函数/包 我试图将 dendogram 转换为“newick”格式,但我不确定这...

R 中可变长度轨迹的聚类

作者:rb446611 提问时间:10/28/2023

我有一个数据集,其中包含多个可变长度的空间路径轨迹(即 X 和 Y 坐标的时间序列)。我希望根据它们形状的相似性对它们进行分组(例如,圆形的轨迹将组合在一起,三角形的轨迹将组合在一起),并倾向于使用分...

无法仅使用 sns.heatmap 复制聚类图图

作者:athantas 提问时间:11/1/2023

给定一个链接矩阵,我从中得到的热图与我使用的热图不同。Zg = sns.clustermap(corr)sns.heatmap(corr[np.ix_(g.dendrogram_row.reorder...


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