我目前正在处理一个文件（一个文本文件），其中包含 DNA 提取序列（重叠群）列表，每个序列都有一个标题，后跟核苷酸行，这是该重叠群的核苷酸长度。有 120 个重叠群，每个条目都用以“>”开头的行标记，...

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这是一个生物信息学问题。 对于那些熟悉 ggtree 的人，我该如何在 ggtree 中注释每个节点和提示的数字信息？ 例如，假设我有一个系统发育树，对于每个节点和尖端，我都有一个基因计数。如何在...

你好，我有一个问题。 我有两个这样的列表： list1 = ['G','C','A','T','C','A'] list2 = ['G','A','*','T','AC','A'] 我想在 p...

我在 Windows 2 上使用 dada 1.22.0 版本“10”，我有压缩 （.gz） fastq 文件列表，当我使用函数 filterAndTrim 时，我收到以下错误消息： add（bin...

是否可以将 DeseqStats 对象从 PyDESeq2 转换为 Pandas DataFrame？ results_summary = stat_res results_as_html = re...

我想得到一个 fastq 文件，其中包含 fastq 读取，这些读取在 中但不在 .F1.fastqF2.fastq 此处提供了以下代码作为解决方案。 needed_reads = [] read...

我正在尝试转换从 NCBI 下载的文件，其中包含细菌基因组的重叠群。为了进一步分析，我需要以 FASta 格式提供它。 我尝试通过 seqkit 进行转换，但它不起作用。...

我是RNA测序的新手，我的比对有问题。我正在使用 STAR，但我似乎缺少我认为下一步需要的输出文件之一。我找不到我的文件。Aligned.sortedbyCoord.out.bam 这是我正在使用的...

闭。这个问题与编程或软件开发无关。它目前不接受答案。 这个问题似乎不是关于特定的编程问题、软件算法或程序员主要使用的软件工具。如果您认为该问题在另一个 Stack Exchange 站点上是主题，您...