我在 Windows 2 上使用 dada 1.22.0 版本“10”，我有压缩 （.gz） fastq 文件列表，当我使用函数 filterAndTrim 时，我收到以下错误消息： add（bin...

是否可以将 DeseqStats 对象从 PyDESeq2 转换为 Pandas DataFrame？ results_summary = stat_res results_as_html = re...

在哪里可以找到fastq格式的公开的正常人类样本（非疾病）RNA seq数据，最好使用Illumina平台进行测序。我在哪里可以找到这样的fastq文件？...

我正在尝试转换从 NCBI 下载的文件，其中包含细菌基因组的重叠群。为了进一步分析，我需要以 FASta 格式提供它。 我尝试通过 seqkit 进行转换，但它不起作用。...

当我尝试处理 Fastq 文件时，发生了以下错误。谁能帮我解决这个错误？ 错误如图所示 我尝试了这个代码：./run_swift_sarscov2_docker.sh -v sarscov2_v2...

目前，我正在尝试过滤一些用于单细胞RNA测序的数据，这个过程需要使用python。我正在尝试运行以下代码，但遇到了一些错误。 %pylab inline import warnings warni...

我正在使用 snakemake 版本 7.30.1 我正在尝试使用 snakemake --cores 4 运行我的 snakemake 工作流程。Snakemake 似乎能够找到输入文件，并且似乎...

我是RNA测序的新手，我的比对有问题。我正在使用 STAR，但我似乎缺少我认为下一步需要的输出文件之一。我找不到我的文件。Aligned.sortedbyCoord.out.bam 这是我正在使用的...

我正在尝试使用 R 中的贝叶斯空间包执行单细胞数据分析。为此，我需要构造一个 SingleCellExperiment 对象。我尝试了以下代码， colData \<- read.csv("kidn...

这个问题在这里已经有答案了： 如何将数据从长格式重塑为宽格式 （14 个答案） 11天前关闭。 亲爱的stackoverflow社区， 我想我对 R 有经验，但上周 R 证明我错了。 我认为我的问...